Protein–RNA interactions for Protein: P62249

RPS16, 40S ribosomal protein S16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS16P62249 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPS16P62249 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPS16P62249 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS16P62249 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS16P62249 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
RPS16P62249 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPS16P62249 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS16P62249 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPS16P62249 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPS16P62249 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPS16P62249 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPS16P62249 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS16P62249 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS16P62249 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPS16P62249 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS16P62249 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPS16P62249 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPS16P62249 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS16P62249 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS16P62249 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPS16P62249 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPS16P62249 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPS16P62249 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPS16P62249 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS16P62249 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPS16P62249 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS16P62249 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPS16P62249 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS16P62249 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS16P62249 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPS16P62249 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS16P62249 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS16P62249 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPS16P62249 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPS16P62249 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS16P62249 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPS16P62249 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPS16P62249 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPS16P62249 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS16P62249 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
RPS16P62249 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS16P62249 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RPS16P62249 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS16P62249 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RPS16P62249 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS16P62249 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RPS16P62249 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RPS16P62249 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS16P62249 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS16P62249 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS16P62249 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS16P62249 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RPS16P62249 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS16P62249 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RPS16P62249 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS16P62249 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS16P62249 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RPS16P62249 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS16P62249 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
RPS16P62249 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
RPS16P62249 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS16P62249 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RPS16P62249 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS16P62249 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RPS16P62249 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS16P62249 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS16P62249 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RPS16P62249 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS16P62249 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS16P62249 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS16P62249 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RPS16P62249 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RPS16P62249 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RPS16P62249 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS16P62249 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS16P62249 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RPS16P62249 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS16P62249 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS16P62249 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPS16P62249 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPS16P62249 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS16P62249 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS16P62249 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS16P62249 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPS16P62249 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPS16P62249 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS16P62249 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPS16P62249 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS16P62249 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPS16P62249 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms