Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KLF3P57682 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF3P57682 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF3P57682 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KLF3P57682 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF3P57682 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF3P57682 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF3P57682 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KLF3P57682 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KLF3P57682 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF3P57682 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF3P57682 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
KLF3P57682 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF3P57682 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF3P57682 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
KLF3P57682 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF3P57682 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF3P57682 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF3P57682 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF3P57682 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
KLF3P57682 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF3P57682 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF3P57682 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
KLF3P57682 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF3P57682 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF3P57682 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
KLF3P57682 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
KLF3P57682 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
KLF3P57682 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KLF3P57682 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
KLF3P57682 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
KLF3P57682 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
KLF3P57682 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF3P57682 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF3P57682 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
KLF3P57682 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
KLF3P57682 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF3P57682 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF3P57682 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
KLF3P57682 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
KLF3P57682 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
KLF3P57682 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF3P57682 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF3P57682 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
KLF3P57682 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
KLF3P57682 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF3P57682 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF3P57682 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF3P57682 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
KLF3P57682 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF3P57682 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
KLF3P57682 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF3P57682 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
KLF3P57682 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF3P57682 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
KLF3P57682 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF3P57682 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
KLF3P57682 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
KLF3P57682 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF3P57682 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF3P57682 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
KLF3P57682 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF3P57682 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF3P57682 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
KLF3P57682 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
KLF3P57682 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
KLF3P57682 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF3P57682 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF3P57682 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
KLF3P57682 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF3P57682 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF3P57682 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF3P57682 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF3P57682 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
KLF3P57682 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF3P57682 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
KLF3P57682 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF3P57682 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
KLF3P57682 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF3P57682 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF3P57682 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
KLF3P57682 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF3P57682 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF3P57682 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
KLF3P57682 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
KLF3P57682 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF3P57682 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF3P57682 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF3P57682 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF3P57682 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
KLF3P57682 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF3P57682 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF3P57682 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF3P57682 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
KLF3P57682 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms