Protein–RNA interactions for Protein: P57088

TMEM33, Transmembrane protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM33P57088 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM33P57088 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMEM33P57088 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TMEM33P57088 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TMEM33P57088 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TMEM33P57088 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM33P57088 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TMEM33P57088 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TMEM33P57088 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms