Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLDN20P56880 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLDN20P56880 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLDN20P56880 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN20P56880 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN20P56880 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN20P56880 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLDN20P56880 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLDN20P56880 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLDN20P56880 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms