Protein–RNA interactions for Protein: P56880

CLDN20, Claudin-20, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN20P56880 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CLDN20P56880 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CLDN20P56880 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
CLDN20P56880 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
CLDN20P56880 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
CLDN20P56880 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CLDN20P56880 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CLDN20P56880 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CLDN20P56880 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CLDN20P56880 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CLDN20P56880 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CLDN20P56880 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CLDN20P56880 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CLDN20P56880 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CLDN20P56880 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CLDN20P56880 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CLDN20P56880 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CLDN20P56880 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CLDN20P56880 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CLDN20P56880 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CLDN20P56880 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CLDN20P56880 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN20P56880 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLDN20P56880 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLDN20P56880 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLDN20P56880 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLDN20P56880 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLDN20P56880 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLDN20P56880 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLDN20P56880 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLDN20P56880 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLDN20P56880 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLDN20P56880 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLDN20P56880 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLDN20P56880 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLDN20P56880 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN20P56880 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLDN20P56880 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CLDN20P56880 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN20P56880 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CLDN20P56880 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CLDN20P56880 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CLDN20P56880 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CLDN20P56880 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CLDN20P56880 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CLDN20P56880 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CLDN20P56880 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLDN20P56880 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN20P56880 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLDN20P56880 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLDN20P56880 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLDN20P56880 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CLDN20P56880 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN20P56880 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CLDN20P56880 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CLDN20P56880 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLDN20P56880 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLDN20P56880 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLDN20P56880 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLDN20P56880 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLDN20P56880 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLDN20P56880 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CLDN20P56880 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN20P56880 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLDN20P56880 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CLDN20P56880 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CLDN20P56880 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CLDN20P56880 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CLDN20P56880 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CLDN20P56880 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN20P56880 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CLDN20P56880 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CLDN20P56880 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
CLDN20P56880 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CLDN20P56880 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CLDN20P56880 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN20P56880 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CLDN20P56880 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CLDN20P56880 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CLDN20P56880 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CLDN20P56880 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CLDN20P56880 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLDN20P56880 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CLDN20P56880 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLDN20P56880 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN20P56880 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CLDN20P56880 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLDN20P56880 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CLDN20P56880 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CLDN20P56880 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN20P56880 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CLDN20P56880 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CLDN20P56880 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CLDN20P56880 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms