Protein–RNA interactions for Protein: P55085

F2RL1, Proteinase-activated receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F2RL1P55085 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
F2RL1P55085 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
F2RL1P55085 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
F2RL1P55085 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
F2RL1P55085 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
F2RL1P55085 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
F2RL1P55085 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
F2RL1P55085 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
F2RL1P55085 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms