Protein–RNA interactions for Protein: P54108

CRISP3, Cysteine-rich secretory protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP3P54108 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRISP3P54108 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CRISP3P54108 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CRISP3P54108 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CRISP3P54108 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CRISP3P54108 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CRISP3P54108 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CRISP3P54108 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CRISP3P54108 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.7 ms