Protein–RNA interactions for Protein: P51817

PRKX, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit PRKX, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKXP51817 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKXP51817 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKXP51817 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKXP51817 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKXP51817 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKXP51817 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKXP51817 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKXP51817 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKXP51817 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKXP51817 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKXP51817 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKXP51817 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKXP51817 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKXP51817 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKXP51817 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKXP51817 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKXP51817 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKXP51817 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKXP51817 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKXP51817 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKXP51817 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKXP51817 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKXP51817 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKXP51817 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKXP51817 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKXP51817 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKXP51817 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKXP51817 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKXP51817 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKXP51817 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKXP51817 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKXP51817 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRKXP51817 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKXP51817 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKXP51817 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKXP51817 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRKXP51817 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKXP51817 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRKXP51817 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRKXP51817 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKXP51817 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRKXP51817 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRKXP51817 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKXP51817 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRKXP51817 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKXP51817 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRKXP51817 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRKXP51817 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRKXP51817 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKXP51817 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKXP51817 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKXP51817 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKXP51817 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRKXP51817 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKXP51817 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKXP51817 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKXP51817 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKXP51817 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRKXP51817 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKXP51817 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKXP51817 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PRKXP51817 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKXP51817 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PRKXP51817 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKXP51817 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKXP51817 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PRKXP51817 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKXP51817 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PRKXP51817 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PRKXP51817 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKXP51817 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRKXP51817 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRKXP51817 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKXP51817 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKXP51817 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRKXP51817 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKXP51817 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRKXP51817 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKXP51817 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRKXP51817 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRKXP51817 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRKXP51817 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKXP51817 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKXP51817 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKXP51817 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRKXP51817 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKXP51817 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKXP51817 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKXP51817 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRKXP51817 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms