Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
GABRB3P28472 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABRB3P28472 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
GABRB3P28472 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GABRB3P28472 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABRB3P28472 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABRB3P28472 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GABRB3P28472 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GABRB3P28472 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GABRB3P28472 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GABRB3P28472 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GABRB3P28472 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms