Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
GABRB3P28472 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GABRB3P28472 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GABRB3P28472 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GABRB3P28472 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
GABRB3P28472 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
GABRB3P28472 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
GABRB3P28472 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
GABRB3P28472 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
GABRB3P28472 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GABRB3P28472 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
GABRB3P28472 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GABRB3P28472 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GABRB3P28472 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
GABRB3P28472 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GABRB3P28472 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GABRB3P28472 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
GABRB3P28472 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
GABRB3P28472 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
GABRB3P28472 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
GABRB3P28472 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
GABRB3P28472 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GABRB3P28472 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GABRB3P28472 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GABRB3P28472 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GABRB3P28472 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GABRB3P28472 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GABRB3P28472 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GABRB3P28472 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GABRB3P28472 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GABRB3P28472 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
GABRB3P28472 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
GABRB3P28472 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GABRB3P28472 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
GABRB3P28472 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
GABRB3P28472 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
GABRB3P28472 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
GABRB3P28472 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
GABRB3P28472 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
GABRB3P28472 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
GABRB3P28472 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
GABRB3P28472 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
GABRB3P28472 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
GABRB3P28472 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
GABRB3P28472 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
GABRB3P28472 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
GABRB3P28472 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
GABRB3P28472 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
GABRB3P28472 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GABRB3P28472 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GABRB3P28472 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GABRB3P28472 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GABRB3P28472 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
GABRB3P28472 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GABRB3P28472 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GABRB3P28472 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GABRB3P28472 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GABRB3P28472 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GABRB3P28472 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GABRB3P28472 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GABRB3P28472 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GABRB3P28472 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GABRB3P28472 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
GABRB3P28472 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
GABRB3P28472 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
GABRB3P28472 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GABRB3P28472 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GABRB3P28472 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GABRB3P28472 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GABRB3P28472 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
GABRB3P28472 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GABRB3P28472 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GABRB3P28472 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABRB3P28472 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GABRB3P28472 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GABRB3P28472 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
GABRB3P28472 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GABRB3P28472 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABRB3P28472 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GABRB3P28472 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
GABRB3P28472 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
GABRB3P28472 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
GABRB3P28472 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
GABRB3P28472 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABRB3P28472 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
GABRB3P28472 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
GABRB3P28472 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
GABRB3P28472 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
GABRB3P28472 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms