Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
XRCC1P18887 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
XRCC1P18887 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
XRCC1P18887 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.88
XRCC1P18887 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
XRCC1P18887 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
XRCC1P18887 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
XRCC1P18887 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
XRCC1P18887 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
XRCC1P18887 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms