Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
GFAPP14136 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
GFAPP14136 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFAPP14136 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFAPP14136 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GFAPP14136 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFAPP14136 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GFAPP14136 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFAPP14136 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFAPP14136 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GFAPP14136 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFAPP14136 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFAPP14136 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GFAPP14136 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFAPP14136 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GFAPP14136 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFAPP14136 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFAPP14136 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFAPP14136 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GFAPP14136 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GFAPP14136 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GFAPP14136 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GFAPP14136 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GFAPP14136 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFAPP14136 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GFAPP14136 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFAPP14136 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFAPP14136 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GFAPP14136 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GFAPP14136 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GFAPP14136 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
GFAPP14136 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
GFAPP14136 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GFAPP14136 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
GFAPP14136 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GFAPP14136 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GFAPP14136 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFAPP14136 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
GFAPP14136 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFAPP14136 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GFAPP14136 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFAPP14136 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GFAPP14136 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
GFAPP14136 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFAPP14136 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
GFAPP14136 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFAPP14136 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
GFAPP14136 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GFAPP14136 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFAPP14136 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GFAPP14136 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GFAPP14136 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFAPP14136 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFAPP14136 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFAPP14136 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GFAPP14136 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFAPP14136 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GFAPP14136 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFAPP14136 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GFAPP14136 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFAPP14136 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFAPP14136 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFAPP14136 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GFAPP14136 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFAPP14136 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFAPP14136 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFAPP14136 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFAPP14136 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GFAPP14136 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFAPP14136 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GFAPP14136 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GFAPP14136 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFAPP14136 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GFAPP14136 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GFAPP14136 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GFAPP14136 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFAPP14136 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFAPP14136 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GFAPP14136 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFAPP14136 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFAPP14136 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
GFAPP14136 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFAPP14136 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GFAPP14136 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFAPP14136 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFAPP14136 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFAPP14136 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFAPP14136 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GFAPP14136 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFAPP14136 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GFAPP14136 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GFAPP14136 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms