Protein–RNA interactions for Protein: P12081

HARS, Histidine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARSP12081 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
HARSP12081 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
HARSP12081 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
HARSP12081 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
HARSP12081 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HARSP12081 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.71■■■□□ 2.35
HARSP12081 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
HARSP12081 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
HARSP12081 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
HARSP12081 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HARSP12081 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HARSP12081 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
HARSP12081 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
HARSP12081 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
HARSP12081 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
HARSP12081 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
HARSP12081 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
HARSP12081 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
HARSP12081 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
HARSP12081 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
HARSP12081 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HARSP12081 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
HARSP12081 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HARSP12081 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
HARSP12081 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
HARSP12081 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
HARSP12081 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HARSP12081 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
HARSP12081 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
HARSP12081 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HARSP12081 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
HARSP12081 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
HARSP12081 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
HARSP12081 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HARSP12081 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
HARSP12081 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
HARSP12081 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
HARSP12081 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
HARSP12081 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HARSP12081 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
HARSP12081 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HARSP12081 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HARSP12081 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
HARSP12081 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HARSP12081 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
HARSP12081 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
HARSP12081 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HARSP12081 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HARSP12081 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
HARSP12081 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HARSP12081 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HARSP12081 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HARSP12081 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HARSP12081 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HARSP12081 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HARSP12081 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HARSP12081 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HARSP12081 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HARSP12081 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HARSP12081 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HARSP12081 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HARSP12081 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HARSP12081 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HARSP12081 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HARSP12081 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HARSP12081 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HARSP12081 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HARSP12081 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HARSP12081 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HARSP12081 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HARSP12081 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HARSP12081 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HARSP12081 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
HARSP12081 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HARSP12081 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
HARSP12081 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HARSP12081 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
HARSP12081 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
HARSP12081 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HARSP12081 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
HARSP12081 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
HARSP12081 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
HARSP12081 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HARSP12081 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HARSP12081 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HARSP12081 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HARSP12081 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HARSP12081 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HARSP12081 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HARSP12081 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HARSP12081 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HARSP12081 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
HARSP12081 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms