Protein–RNA interactions for Protein: P0DMB2

C8orf88, Uncharacterized protein C8orf88, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf88P0DMB2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C8orf88P0DMB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC21.28■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
C8orf88P0DMB2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
C8orf88P0DMB2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
C8orf88P0DMB2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
C8orf88P0DMB2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
C8orf88P0DMB2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
C8orf88P0DMB2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
C8orf88P0DMB2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms