Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
RGPD1P0DJD0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RGPD1P0DJD0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
RGPD1P0DJD0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RGPD1P0DJD0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
RGPD1P0DJD0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
RGPD1P0DJD0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.9■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
RGPD1P0DJD0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.87■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.86■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
RGPD1P0DJD0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.8■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.78■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC36.77■■■■□ 3.48
RGPD1P0DJD0 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC36.73■■■■□ 3.47
RGPD1P0DJD0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RGPD1P0DJD0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RGPD1P0DJD0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
RGPD1P0DJD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
RGPD1P0DJD0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.69■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
RGPD1P0DJD0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
RGPD1P0DJD0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
RGPD1P0DJD0 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.45■■■■□ 3.43
RGPD1P0DJD0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
RGPD1P0DJD0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
RGPD1P0DJD0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
RGPD1P0DJD0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms