Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC166P0CW27 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC166P0CW27 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC166P0CW27 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CCDC166P0CW27 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC166P0CW27 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC166P0CW27 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC166P0CW27 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC166P0CW27 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms