Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFP02787 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFP02787 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFP02787 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFP02787 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFP02787 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFP02787 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFP02787 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFP02787 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TFP02787 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFP02787 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFP02787 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFP02787 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TFP02787 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFP02787 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFP02787 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TFP02787 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TFP02787 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TFP02787 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFP02787 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TFP02787 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFP02787 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TFP02787 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TFP02787 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TFP02787 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TFP02787 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFP02787 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFP02787 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TFP02787 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
TFP02787 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFP02787 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFP02787 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TFP02787 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TFP02787 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFP02787 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TFP02787 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFP02787 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TFP02787 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFP02787 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFP02787 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TFP02787 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TFP02787 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TFP02787 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFP02787 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFP02787 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TFP02787 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFP02787 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TFP02787 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFP02787 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TFP02787 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFP02787 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFP02787 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFP02787 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TFP02787 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFP02787 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFP02787 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFP02787 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TFP02787 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TFP02787 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFP02787 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TFP02787 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TFP02787 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFP02787 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFP02787 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TFP02787 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TFP02787 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFP02787 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFP02787 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFP02787 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TFP02787 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFP02787 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TFP02787 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TFP02787 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TFP02787 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TFP02787 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFP02787 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFP02787 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFP02787 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TFP02787 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TFP02787 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TFP02787 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TFP02787 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFP02787 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFP02787 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TFP02787 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
TFP02787 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TFP02787 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFP02787 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFP02787 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TFP02787 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms