Protein–RNA interactions for Protein: P02787

TF, Serotransferrin, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFP02787 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TFP02787 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TFP02787 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
TFP02787 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TFP02787 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TFP02787 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TFP02787 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TFP02787 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TFP02787 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TFP02787 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TFP02787 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TFP02787 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TFP02787 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TFP02787 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFP02787 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFP02787 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFP02787 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFP02787 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFP02787 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TFP02787 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
TFP02787 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TFP02787 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TFP02787 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TFP02787 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TFP02787 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TFP02787 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TFP02787 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFP02787 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TFP02787 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TFP02787 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TFP02787 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TFP02787 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TFP02787 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TFP02787 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TFP02787 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TFP02787 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TFP02787 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TFP02787 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFP02787 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFP02787 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TFP02787 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TFP02787 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TFP02787 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TFP02787 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TFP02787 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TFP02787 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
TFP02787 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TFP02787 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TFP02787 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TFP02787 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TFP02787 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TFP02787 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TFP02787 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TFP02787 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TFP02787 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TFP02787 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TFP02787 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFP02787 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFP02787 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TFP02787 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TFP02787 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TFP02787 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TFP02787 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TFP02787 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TFP02787 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFP02787 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TFP02787 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFP02787 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TFP02787 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFP02787 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TFP02787 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFP02787 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TFP02787 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TFP02787 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFP02787 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TFP02787 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TFP02787 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TFP02787 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFP02787 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TFP02787 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TFP02787 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TFP02787 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TFP02787 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TFP02787 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TFP02787 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TFP02787 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFP02787 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TFP02787 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFP02787 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TFP02787 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TFP02787 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TFP02787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TFP02787 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TFP02787 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFP02787 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TFP02787 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TFP02787 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TFP02787 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TFP02787 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TFP02787 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms