Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
APOC1P02654 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC1P02654 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC1P02654 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC1P02654 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC1P02654 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOC1P02654 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOC1P02654 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC1P02654 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC1P02654 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC1P02654 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC1P02654 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOC1P02654 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC1P02654 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOC1P02654 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC1P02654 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC1P02654 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOC1P02654 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC1P02654 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC1P02654 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOC1P02654 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APOC1P02654 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC1P02654 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC1P02654 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APOC1P02654 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC1P02654 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC1P02654 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOC1P02654 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC1P02654 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC1P02654 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOC1P02654 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOC1P02654 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOC1P02654 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC1P02654 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC1P02654 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOC1P02654 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOC1P02654 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOC1P02654 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOC1P02654 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
APOC1P02654 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
APOC1P02654 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC1P02654 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC1P02654 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
APOC1P02654 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC1P02654 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC1P02654 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
APOC1P02654 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
APOC1P02654 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
APOC1P02654 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC1P02654 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC1P02654 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC1P02654 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
APOC1P02654 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC1P02654 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC1P02654 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
APOC1P02654 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC1P02654 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
APOC1P02654 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
APOC1P02654 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC1P02654 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
APOC1P02654 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
APOC1P02654 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
APOC1P02654 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
APOC1P02654 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC1P02654 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC1P02654 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC1P02654 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
APOC1P02654 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC1P02654 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
APOC1P02654 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC1P02654 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC1P02654 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
APOC1P02654 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
APOC1P02654 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC1P02654 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC1P02654 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC1P02654 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
APOC1P02654 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC1P02654 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC1P02654 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
APOC1P02654 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC1P02654 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
APOC1P02654 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
APOC1P02654 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
APOC1P02654 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC1P02654 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
APOC1P02654 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC1P02654 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC1P02654 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC1P02654 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
APOC1P02654 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
APOC1P02654 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
APOC1P02654 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
APOC1P02654 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms