Protein–RNA interactions for Protein: P02008

HBZ, Hemoglobin subunit zeta, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBZP02008 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HBZP02008 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBZP02008 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBZP02008 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBZP02008 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBZP02008 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
HBZP02008 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBZP02008 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBZP02008 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HBZP02008 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HBZP02008 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HBZP02008 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBZP02008 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HBZP02008 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HBZP02008 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBZP02008 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HBZP02008 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBZP02008 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HBZP02008 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBZP02008 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HBZP02008 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBZP02008 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBZP02008 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HBZP02008 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HBZP02008 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HBZP02008 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBZP02008 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HBZP02008 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBZP02008 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBZP02008 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HBZP02008 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HBZP02008 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HBZP02008 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBZP02008 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBZP02008 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HBZP02008 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBZP02008 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBZP02008 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBZP02008 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HBZP02008 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HBZP02008 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBZP02008 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBZP02008 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HBZP02008 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBZP02008 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBZP02008 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBZP02008 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HBZP02008 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBZP02008 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBZP02008 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBZP02008 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HBZP02008 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBZP02008 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HBZP02008 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBZP02008 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBZP02008 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HBZP02008 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HBZP02008 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HBZP02008 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBZP02008 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HBZP02008 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBZP02008 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBZP02008 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HBZP02008 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBZP02008 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HBZP02008 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBZP02008 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HBZP02008 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBZP02008 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBZP02008 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBZP02008 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HBZP02008 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBZP02008 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HBZP02008 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HBZP02008 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBZP02008 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBZP02008 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HBZP02008 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBZP02008 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBZP02008 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBZP02008 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HBZP02008 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HBZP02008 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBZP02008 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBZP02008 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBZP02008 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HBZP02008 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HBZP02008 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBZP02008 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBZP02008 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBZP02008 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HBZP02008 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HBZP02008 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
HBZP02008 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms