Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGHV3-9P01782 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
IGHV3-9P01782 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGHV3-9P01782 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IGHV3-9P01782 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGHV3-9P01782 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGHV3-9P01782 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGHV3-9P01782 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms