Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGHV3-9P01782 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
IGHV3-9P01782 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IGHV3-9P01782 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
IGHV3-9P01782 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
IGHV3-9P01782 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
IGHV3-9P01782 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
IGHV3-9P01782 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
IGHV3-9P01782 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IGHV3-9P01782 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IGHV3-9P01782 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IGHV3-9P01782 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IGHV3-9P01782 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IGHV3-9P01782 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
IGHV3-9P01782 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
IGHV3-9P01782 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
IGHV3-9P01782 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
IGHV3-9P01782 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IGHV3-9P01782 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IGHV3-9P01782 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IGHV3-9P01782 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
IGHV3-9P01782 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
IGHV3-9P01782 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
IGHV3-9P01782 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
IGHV3-9P01782 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
IGHV3-9P01782 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
IGHV3-9P01782 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
IGHV3-9P01782 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
IGHV3-9P01782 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
IGHV3-9P01782 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
IGHV3-9P01782 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
IGHV3-9P01782 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHV3-9P01782 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHV3-9P01782 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
IGHV3-9P01782 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
IGHV3-9P01782 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
IGHV3-9P01782 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
IGHV3-9P01782 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
IGHV3-9P01782 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
IGHV3-9P01782 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
IGHV3-9P01782 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
IGHV3-9P01782 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHV3-9P01782 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGHV3-9P01782 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGHV3-9P01782 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGHV3-9P01782 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGHV3-9P01782 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGHV3-9P01782 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
IGHV3-9P01782 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
IGHV3-9P01782 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
IGHV3-9P01782 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGHV3-9P01782 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
IGHV3-9P01782 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IGHV3-9P01782 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IGHV3-9P01782 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IGHV3-9P01782 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IGHV3-9P01782 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IGHV3-9P01782 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IGHV3-9P01782 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
IGHV3-9P01782 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
IGHV3-9P01782 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
IGHV3-9P01782 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
IGHV3-9P01782 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
IGHV3-9P01782 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
IGHV3-9P01782 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
IGHV3-9P01782 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
IGHV3-9P01782 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
IGHV3-9P01782 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
IGHV3-9P01782 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
IGHV3-9P01782 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGHV3-9P01782 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
IGHV3-9P01782 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
IGHV3-9P01782 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGHV3-9P01782 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGHV3-9P01782 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
IGHV3-9P01782 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
IGHV3-9P01782 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
IGHV3-9P01782 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
IGHV3-9P01782 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
IGHV3-9P01782 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
IGHV3-9P01782 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGHV3-9P01782 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
IGHV3-9P01782 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
IGHV3-9P01782 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
IGHV3-9P01782 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
IGHV3-9P01782 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
IGHV3-9P01782 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
IGHV3-9P01782 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IGHV3-9P01782 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IGHV3-9P01782 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV3-9P01782 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV3-9P01782 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IGHV3-9P01782 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
IGHV3-9P01782 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
IGHV3-9P01782 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms