Protein–RNA interactions for Protein: O95992

CH25H, Cholesterol 25-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CH25HO95992 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CH25HO95992 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CH25HO95992 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CH25HO95992 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CH25HO95992 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CH25HO95992 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CH25HO95992 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CH25HO95992 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CH25HO95992 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CH25HO95992 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CH25HO95992 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CH25HO95992 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CH25HO95992 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CH25HO95992 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CH25HO95992 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CH25HO95992 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CH25HO95992 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CH25HO95992 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CH25HO95992 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CH25HO95992 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CH25HO95992 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CH25HO95992 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CH25HO95992 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CH25HO95992 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CH25HO95992 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CH25HO95992 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CH25HO95992 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CH25HO95992 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CH25HO95992 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CH25HO95992 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CH25HO95992 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CH25HO95992 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CH25HO95992 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CH25HO95992 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CH25HO95992 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CH25HO95992 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CH25HO95992 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CH25HO95992 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CH25HO95992 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CH25HO95992 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CH25HO95992 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CH25HO95992 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CH25HO95992 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CH25HO95992 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CH25HO95992 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CH25HO95992 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CH25HO95992 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CH25HO95992 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CH25HO95992 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CH25HO95992 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CH25HO95992 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CH25HO95992 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CH25HO95992 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CH25HO95992 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CH25HO95992 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CH25HO95992 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CH25HO95992 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CH25HO95992 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CH25HO95992 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CH25HO95992 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CH25HO95992 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CH25HO95992 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CH25HO95992 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CH25HO95992 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CH25HO95992 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CH25HO95992 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CH25HO95992 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CH25HO95992 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CH25HO95992 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CH25HO95992 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CH25HO95992 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CH25HO95992 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CH25HO95992 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CH25HO95992 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CH25HO95992 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CH25HO95992 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CH25HO95992 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CH25HO95992 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CH25HO95992 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CH25HO95992 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CH25HO95992 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CH25HO95992 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CH25HO95992 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CH25HO95992 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CH25HO95992 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CH25HO95992 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CH25HO95992 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CH25HO95992 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CH25HO95992 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CH25HO95992 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CH25HO95992 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CH25HO95992 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CH25HO95992 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CH25HO95992 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CH25HO95992 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CH25HO95992 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CH25HO95992 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CH25HO95992 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CH25HO95992 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CH25HO95992 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms