Protein–RNA interactions for Protein: O95718

ESRRB, Steroid hormone receptor ERR2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRBO95718 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRBO95718 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ESRRBO95718 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ESRRBO95718 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ESRRBO95718 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ESRRBO95718 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
ESRRBO95718 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
ESRRBO95718 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRBO95718 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ESRRBO95718 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms