Protein–RNA interactions for Protein: O75570

MTRF1, Peptide chain release factor 1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTRF1O75570 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
MTRF1O75570 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MTRF1O75570 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTRF1O75570 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MTRF1O75570 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MTRF1O75570 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTRF1O75570 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTRF1O75570 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MTRF1O75570 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MTRF1O75570 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms