Protein–RNA interactions for Protein: O75382

TRIM3, Tripartite motif-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM3O75382 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TRIM3O75382 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM3O75382 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM3O75382 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM3O75382 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM3O75382 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM3O75382 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM3O75382 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms