Protein–RNA interactions for Protein: O60688

YPEL1, Protein yippee-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YPEL1O60688 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YPEL1O60688 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YPEL1O60688 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YPEL1O60688 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
YPEL1O60688 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
YPEL1O60688 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
YPEL1O60688 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
YPEL1O60688 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
YPEL1O60688 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms