Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CACNG3O60359 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CACNG3O60359 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CACNG3O60359 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNG3O60359 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNG3O60359 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CACNG3O60359 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CACNG3O60359 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CACNG3O60359 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CACNG3O60359 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms