Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ACTN4O43707 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ACTN4O43707 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ACTN4O43707 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ACTN4O43707 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ACTN4O43707 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
ACTN4O43707 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
ACTN4O43707 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ACTN4O43707 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ACTN4O43707 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
ACTN4O43707 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ACTN4O43707 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
ACTN4O43707 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
ACTN4O43707 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ACTN4O43707 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
ACTN4O43707 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ACTN4O43707 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ACTN4O43707 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms