Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
ACTN4O43707 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.89■■■■□ 3.66
ACTN4O43707 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
ACTN4O43707 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
ACTN4O43707 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ACTN4O43707 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.53
ACTN4O43707 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.48
ACTN4O43707 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
ACTN4O43707 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
ACTN4O43707 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ACTN4O43707 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ACTN4O43707 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ACTN4O43707 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
ACTN4O43707 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.73■■■■□ 3.31
ACTN4O43707 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
ACTN4O43707 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
ACTN4O43707 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
ACTN4O43707 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
ACTN4O43707 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
ACTN4O43707 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
ACTN4O43707 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ACTN4O43707 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
ACTN4O43707 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
ACTN4O43707 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
ACTN4O43707 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.87■■■■□ 3.17
ACTN4O43707 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.78■■■■□ 3.16
ACTN4O43707 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
ACTN4O43707 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
ACTN4O43707 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
ACTN4O43707 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
ACTN4O43707 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
ACTN4O43707 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
ACTN4O43707 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
ACTN4O43707 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
ACTN4O43707 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
ACTN4O43707 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
ACTN4O43707 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
ACTN4O43707 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
ACTN4O43707 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
ACTN4O43707 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
ACTN4O43707 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
ACTN4O43707 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ACTN4O43707 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
ACTN4O43707 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
ACTN4O43707 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ACTN4O43707 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ACTN4O43707 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ACTN4O43707 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ACTN4O43707 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ACTN4O43707 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
ACTN4O43707 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ACTN4O43707 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ACTN4O43707 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
ACTN4O43707 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ACTN4O43707 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ACTN4O43707 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
ACTN4O43707 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ACTN4O43707 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ACTN4O43707 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ACTN4O43707 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ACTN4O43707 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
ACTN4O43707 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ACTN4O43707 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ACTN4O43707 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ACTN4O43707 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ACTN4O43707 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ACTN4O43707 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ACTN4O43707 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ACTN4O43707 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
ACTN4O43707 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ACTN4O43707 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ACTN4O43707 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ACTN4O43707 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ACTN4O43707 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
ACTN4O43707 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ACTN4O43707 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
ACTN4O43707 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
ACTN4O43707 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
ACTN4O43707 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
ACTN4O43707 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
ACTN4O43707 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
ACTN4O43707 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
ACTN4O43707 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
ACTN4O43707 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
ACTN4O43707 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
ACTN4O43707 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ACTN4O43707 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
ACTN4O43707 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
ACTN4O43707 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
ACTN4O43707 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ACTN4O43707 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ACTN4O43707 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
ACTN4O43707 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ACTN4O43707 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ACTN4O43707 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
ACTN4O43707 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ACTN4O43707 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ACTN4O43707 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
ACTN4O43707 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
ACTN4O43707 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms