Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TRIM38O00635 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRIM38O00635 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRIM38O00635 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
TRIM38O00635 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TRIM38O00635 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
TRIM38O00635 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
TRIM38O00635 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
TRIM38O00635 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms