Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
AP3B1O00203 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
AP3B1O00203 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
AP3B1O00203 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
AP3B1O00203 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
AP3B1O00203 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
AP3B1O00203 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
AP3B1O00203 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
AP3B1O00203 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
AP3B1O00203 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
AP3B1O00203 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms