Protein–RNA interactions for Protein: F8WDY8

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 70 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8WDY8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8WDY8 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
F8WDY8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
F8WDY8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
F8WDY8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8WDY8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
F8WDY8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
F8WDY8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8WDY8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
F8WDY8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
F8WDY8 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
F8WDY8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
F8WDY8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
F8WDY8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
F8WDY8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
F8WDY8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
F8WDY8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
F8WDY8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
F8WDY8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
F8WDY8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8WDY8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
F8WDY8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
F8WDY8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
F8WDY8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
F8WDY8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8WDY8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
F8WDY8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
F8WDY8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
F8WDY8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
F8WDY8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
F8WDY8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
F8WDY8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
F8WDY8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
F8WDY8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
F8WDY8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
F8WDY8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
F8WDY8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms