Protein–RNA interactions for Protein: B1ALY0

PALM2-AKAP2, PALM2-AKAP2 readthrough (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM2-AKAP2B1ALY0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PALM2-AKAP2B1ALY0 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PALM2-AKAP2B1ALY0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PALM2-AKAP2B1ALY0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PALM2-AKAP2B1ALY0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PALM2-AKAP2B1ALY0 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms