Protein–RNA interactions for Protein: Q01085

TIAL1, Nucleolysin TIAR, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIAL1Q01085 ATP6V0B-203ENST00000468183 2432 ntTSL 1 (best)22.1■■□□□ 1.132e-10■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.832e-10■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.652e-10■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-10■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-10■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATF7IP2-205ENST00000535850 1907 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-7■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.323e-7■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATF7IP2-204ENST00000396560 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.393e-7■■■■□ 20
TIAL1Q01085 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.423e-7■■■■□ 20
TIAL1Q01085 CCNI-201ENST00000237654 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.252e-7■■■■□ 20
TIAL1Q01085 HNRNPL-204ENST00000595443 2122 ntTSL 211.5□□□□□ -0.575e-14■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 AC008982.1-201ENST00000594769 963 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.615e-14■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPL-205ENST00000595804 588 ntTSL 28.97□□□□□ -0.975e-14■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 AC008982.1-202ENST00000602021 342 ntTSL 57.54□□□□□ -1.25e-14■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.161e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SLC17A9-202ENST00000370351 3580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.381e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SLC17A9-207ENST00000488738 3992 ntTSL 212.4□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-210ENST00000518480 558 ntTSL 416.48■□□□□ 0.235e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-225ENST00000522890 581 ntTSL 514.61□□□□□ -0.075e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-211ENST00000519228 729 ntTSL 414.31□□□□□ -0.125e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-206ENST00000518010 581 ntTSL 412.99□□□□□ -0.335e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-214ENST00000520230 582 ntTSL 412.64□□□□□ -0.395e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 512.12□□□□□ -0.475e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 49.5□□□□□ -0.895e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NDRG1-227ENST00000523892 562 ntTSL 48.39□□□□□ -1.075e-7■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNMT-205ENST00000467390 532 ntTSL 25.88□□□□□ -1.473e-8■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 25e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.725e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.625e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-206ENST00000430655 2157 ntTSL 1 (best)23.9■■□□□ 1.425e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 STRN3-207ENST00000555358 2208 ntTSL 1 (best)23.51■■□□□ 1.355e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-205ENST00000424847 1563 ntTSL 1 (best)23.02■■□□□ 1.285e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-204ENST00000535009 2175 ntTSL 222.39■■□□□ 1.175e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.15e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 DSCAML1-202ENST00000525836 583 ntTSL 320.83■□□□□ 0.935e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.855e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.835e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.785e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 FDFT1-220ENST00000531733 712 ntTSL 219.77■□□□□ 0.765e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.755e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-207ENST00000433912 1063 ntTSL 219.56■□□□□ 0.725e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-208ENST00000597270 1147 ntTSL 219.14■□□□□ 0.655e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.645e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.615e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.555e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.545e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 LPCAT1-206ENST00000514484 756 ntTSL 318.17■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-214ENST00000600806 2373 ntTSL 518.16■□□□□ 0.55e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-204ENST00000594907 1078 ntTSL 518.1■□□□□ 0.495e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-213ENST00000600092 1086 ntTSL 217.84■□□□□ 0.455e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.435e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.395e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 GNPAT-203ENST00000436239 839 ntAPPRIS ALT2 TSL 317.28■□□□□ 0.365e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 FNBP4-213ENST00000534003 2515 ntTSL 517.12■□□□□ 0.335e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.335e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.315e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.35e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.275e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-220ENST00000524062 2285 ntTSL 216.51■□□□□ 0.235e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 GNPAT-202ENST00000416000 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.17■□□□□ 0.185e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.165e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.15e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.075e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.015e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 05e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.055e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.085e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.125e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-209ENST00000579070 871 ntTSL 314.15□□□□□ -0.145e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.175e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-210ENST00000584968 908 ntTSL 513.94□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNURF-203ENST00000580062 796 ntTSL 313.92□□□□□ -0.185e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-206ENST00000635811 3824 ntTSL 513.66□□□□□ -0.225e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.325e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.365e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 FNBP4-202ENST00000524696 481 ntTSL 312.67□□□□□ -0.385e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-205ENST00000400100 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.45e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.465e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 FXYD2-204ENST00000514385 2872 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.475e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.485e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-212ENST00000490918 3723 ntTSL 211.74□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TUBGCP2-208ENST00000482278 3553 ntTSL 211.72□□□□□ -0.535e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-205ENST00000517509 3456 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.545e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 USP33-204ENST00000370794 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.555e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 ANAPC16-205ENST00000621663 3567 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.635e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPCN2-202ENST00000442692 4376 ntTSL 211.07□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TUBGCP2-201ENST00000252936 3885 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.645e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 STRN3-203ENST00000366206 575 ntTSL 410.98□□□□□ -0.655e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 ANAPC16-201ENST00000299381 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.665e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 BPHL-211ENST00000488487 1137 ntTSL 510.74□□□□□ -0.695e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-208ENST00000577565 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.75e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 RAB11A-203ENST00000564910 978 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.755e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.855e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SLC38A4-202ENST00000447411 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.885e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 H2AFV-203ENST00000349299 596 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.895e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 ANAPC16-204ENST00000615507 3100 ntTSL 3 BASIC9.36□□□□□ -0.915e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 ANAPC16-202ENST00000470481 1828 ntTSL 1 (best)8.9□□□□□ -0.985e-6■■■■□ 19.9
TIAL1Q01085 SNRPN-204ENST00000400098 525 ntTSL 48.68□□□□□ -1.025e-6■■■■□ 19.9
Retrieved 100 of 8,119 protein–RNA pairs in 123.3 ms