Protein–RNA interactions for Protein: P35269

GTF2F1, General transcription factor IIF subunit 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F1P35269 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.592e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BCL9L-205ENST00000532899 611 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HDAC6-235ENST00000495515 569 ntTSL 318.28■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-225ENST00000494465 2365 ntTSL 518.22■□□□□ 0.512e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-216ENST00000475195 762 ntTSL 218.03■□□□□ 0.482e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.462e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.432e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-203ENST00000400772 625 ntTSL 417.68■□□□□ 0.422e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PNCK-217ENST00000460106 586 ntTSL 417.63■□□□□ 0.412e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-220ENST00000482507 2414 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.392e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.382e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AMPD2-220ENST00000528958 714 ntTSL 217.39■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HDAC6-218ENST00000470942 668 ntTSL 317.34■□□□□ 0.372e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.352e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-209ENST00000425239 807 ntTSL 217.17■□□□□ 0.342e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-202ENST00000400771 663 ntTSL 517.13■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.333e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-202ENST00000378307 890 ntTSL 1 (best)17.08■□□□□ 0.322e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 DGKQ-203ENST00000509465 4362 ntAPPRIS ALT2 TSL 516.81■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-215ENST00000468018 721 ntTSL 516.71■□□□□ 0.272e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHST12-203ENST00000432336 921 ntTSL 216.54■□□□□ 0.242e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-223ENST00000493618 899 ntTSL 516.51■□□□□ 0.232e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-236ENST00000602111 781 ntTSL 316.45■□□□□ 0.223e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-222ENST00000491867 435 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-214ENST00000465399 581 ntTSL 216.15■□□□□ 0.182e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 USP36-221ENST00000592231 2479 ntTSL 216.13■□□□□ 0.172e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-218ENST00000479554 556 ntTSL 416.07■□□□□ 0.162e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 USP36-207ENST00000587010 607 ntTSL 315.98■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-204ENST00000397790 3453 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.152e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC15.89■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.132e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHTF18-212ENST00000493715 691 ntTSL 315.63■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HDAC6-215ENST00000465457 563 ntTSL 515.6■□□□□ 0.092e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 KIAA0100-210ENST00000580882 1582 ntTSL 1 (best)15.52■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 B3GNTL1-206ENST00000571954 881 ntTSL 515.49■□□□□ 0.072e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.043e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.012e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-208ENST00000595033 2907 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HGSNAT-208ENST00000522082 560 ntTSL 414.53□□□□□ -0.082e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-202ENST00000461166 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.122e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 NFATC1-202ENST00000318065 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-234ENST00000600676 3094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.153e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 RAB4B-208ENST00000602173 592 ntTSL 314.1□□□□□ -0.152e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-218ENST00000596951 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.183e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PXMP4-203ENST00000409299 5684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.192e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HDAC6-229ENST00000486665 598 ntTSL 213.68□□□□□ -0.222e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HGSNAT-201ENST00000379644 5236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-208ENST00000419606 553 ntTSL 413.6□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AMPD2-211ENST00000479919 690 ntTSL 313.14□□□□□ -0.312e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHERP-203ENST00000546361 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SNRPE-203ENST00000469451 248 ntTSL 312.84□□□□□ -0.352e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 FCHO1-216ENST00000596536 3204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-6■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-207ENST00000415107 356 ntTSL 512.72□□□□□ -0.372e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HDAC6-228ENST00000486227 4718 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-202ENST00000334743 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.422e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHERP-201ENST00000198939 4084 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 AMPD2-205ENST00000393688 3217 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 HGSNAT-210ENST00000524016 757 ntTSL 412.28□□□□□ -0.442e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATG4B-212ENST00000430617 623 ntTSL 311.87□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-203ENST00000350249 3845 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.542e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 MIA-RAB4B-201ENST00000600729 1229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.552e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 USP36-219ENST00000591052 427 ntTSL 311.43□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 USP36-208ENST00000587379 606 ntTSL 310.93□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SNRPE-202ENST00000414487 942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.682e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 B3GNTL1-210ENST00000573629 423 ntTSL 310.53□□□□□ -0.722e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 USP36-211ENST00000588130 602 ntTSL 29.75□□□□□ -0.852e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SNRPE-205ENST00000475035 532 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.872e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CHST12-201ENST00000258711 15979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.012e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-206ENST00000495891 2700 ntTSL 1 (best)8.13□□□□□ -1.112e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 IGF2R-201ENST00000356956 14044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.122e-12■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC7.88□□□□□ -1.152e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.282e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-204ENST00000481853 2035 ntTSL 1 (best)7□□□□□ -1.292e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-214ENST00000555237 607 ntTSL 56.75□□□□□ -1.332e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.342e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PPP2R5C-225ENST00000557071 798 ntTSL 36.27□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-205ENST00000486483 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.422e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.432e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TIPARP-207ENST00000542783 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.472e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 SNRPE-204ENST00000470492 478 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.662e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 TOR1A-203ENST00000473604 1055 ntTSL 522.54■■□□□ 1.26e-8■■■■■ 34.1
GTF2F1P35269 CDC42-204ENST00000411827 597 ntTSL 319.49■□□□□ 0.717e-7■■■■■ 34
GTF2F1P35269 POLA2-202ENST00000525924 873 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 34
GTF2F1P35269 EIF6-208ENST00000462894 453 ntTSL 329.63■■■□□ 2.337e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.597e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-207ENST00000456600 551 ntTSL 324.16■■□□□ 1.467e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.467e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-204ENST00000415116 739 ntTSL 522.46■■□□□ 1.197e-23■■■■■ 33.9
GTF2F1P35269 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.627e-23■■■■■ 33.9
Retrieved 100 of 18,214 protein–RNA pairs in 94.8 ms