RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491867.5

ATG4B-222, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 435 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-222ENST00000491867 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.58■■■■□ 3.29
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ATG4B-222ENST00000491867 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.63■■■□□ 2.49
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ATG4B-222ENST00000491867 SCRIBQ14160 1630 aa29.34■■■□□ 2.29
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ATG4B-222ENST00000491867 HMGXB3Q12766 1538 aa27.99■■■□□ 2.07
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ATG4B-222ENST00000491867 SMARCA4P51532 1647 aa27.89■■■□□ 2.05
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ATG4B-222ENST00000491867 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa27.65■■■□□ 2.02
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ATG4B-222ENST00000491867 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.43■■□□□ 1.98
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ATG4B-222ENST00000491867 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.19■■□□□ 1.94
ATG4B-222ENST00000491867 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.12■■□□□ 1.93
ATG4B-222ENST00000491867 WIZO95785 1651 aa27.04■■□□□ 1.92
ATG4B-222ENST00000491867 CFTRP13569 1480 aa26.95■■□□□ 1.91
ATG4B-222ENST00000491867 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-222ENST00000491867 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-222ENST00000491867 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-222ENST00000491867 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP26.94■■□□□ 1.9
ATG4B-222ENST00000491867 ARHGEF11O15085 1522 aa26.8■■□□□ 1.88
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ATG4B-222ENST00000491867 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.73■■□□□ 1.87
ATG4B-222ENST00000491867 IFT140Q96RY7 1462 aa26.68■■□□□ 1.86
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ATG4B-222ENST00000491867 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
ATG4B-222ENST00000491867 PRDM2Q13029 1718 aa26.52■■□□□ 1.84
ATG4B-222ENST00000491867 TOPBP1Q92547 1522 aa26.52■■□□□ 1.84
ATG4B-222ENST00000491867 ARAP1Q96P48 1450 aa26.51■■□□□ 1.83
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ATG4B-222ENST00000491867 FBLN2P98095 1184 aa26.43■■□□□ 1.82
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ATG4B-222ENST00000491867 CHD1O14646 1710 aa26.42■■□□□ 1.82
ATG4B-222ENST00000491867 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.4■■□□□ 1.82
ATG4B-222ENST00000491867 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
ATG4B-222ENST00000491867 ABCC8Q09428 1581 aa26.38■■□□□ 1.81
ATG4B-222ENST00000491867 DNMBPQ6XZF7 1577 aa26.33■■□□□ 1.8
ATG4B-222ENST00000491867 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
ATG4B-222ENST00000491867 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.78
ATG4B-222ENST00000491867 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
ATG4B-222ENST00000491867 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.15■■□□□ 1.78
ATG4B-222ENST00000491867 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.12■■□□□ 1.77
ATG4B-222ENST00000491867 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.11■■□□□ 1.77
ATG4B-222ENST00000491867 SOGA1O94964 1423 aa26.1■■□□□ 1.77
ATG4B-222ENST00000491867 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
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ATG4B-222ENST00000491867 WDR97A6NE52 1622 aa25.96■■□□□ 1.75
ATG4B-222ENST00000491867 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.94■■□□□ 1.74
ATG4B-222ENST00000491867 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG4B-222ENST00000491867 GRIN2BQ13224 1484 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4B-222ENST00000491867 SYNJ2O15056 1496 aa25.91■■□□□ 1.74
ATG4B-222ENST00000491867 CUX1P39880 1505 aa25.81■■□□□ 1.72
ATG4B-222ENST00000491867 PBRM1Q86U86 1689 aa25.71■■□□□ 1.71
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ATG4B-222ENST00000491867 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.6■■□□□ 1.69
ATG4B-222ENST00000491867 GRIN2AQ12879 1464 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-222ENST00000491867 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.59■■□□□ 1.69
ATG4B-222ENST00000491867 CEP170Q5SW79 1584 aa25.57■■□□□ 1.68
ATG4B-222ENST00000491867 NUP160Q12769 1436 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG4B-222ENST00000491867 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.49■■□□□ 1.67
ATG4B-222ENST00000491867 ADAMTS12P58397 1594 aa25.46■■□□□ 1.67
ATG4B-222ENST00000491867 SHROOM2Q13796 1616 aa25.45■■□□□ 1.67
ATG4B-222ENST00000491867 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.4■■□□□ 1.66
ATG4B-222ENST00000491867 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.39■■□□□ 1.66
ATG4B-222ENST00000491867 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
ATG4B-222ENST00000491867 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
ATG4B-222ENST00000491867 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.34■■□□□ 1.65
ATG4B-222ENST00000491867 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.33■■□□□ 1.65
ATG4B-222ENST00000491867 JPH4Q96JJ6 628 aa25.32■■□□□ 1.64
ATG4B-222ENST00000491867 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
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