RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602111.5

FCHO1-236, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

TSL 3

Gene FCHO1, Length 781 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-236ENST00000602111 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.88■■■■□ 3.33
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FCHO1-236ENST00000602111 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa32.51■■■□□ 2.8
FCHO1-236ENST00000602111 DNAJC5BQ9UF47 199 aa31.87■■■□□ 2.69
FCHO1-236ENST00000602111 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.32■■■□□ 2.6
FCHO1-236ENST00000602111 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.91■■■□□ 2.54
FCHO1-236ENST00000602111 NACADO15069 1562 aa30.88■■■□□ 2.53
FCHO1-236ENST00000602111 DCAF8L2P0C7V8 631 aa30.7■■■□□ 2.51
FCHO1-236ENST00000602111 UNC13AQ9UPW8 1703 aa30.67■■■□□ 2.5
FCHO1-236ENST00000602111 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.46■■■□□ 2.47
FCHO1-236ENST00000602111 MYO15BQ96JP2 1530 aa30.13■■■□□ 2.41
FCHO1-236ENST00000602111 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.06■■■□□ 2.4
FCHO1-236ENST00000602111 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.04■■■□□ 2.4
FCHO1-236ENST00000602111 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.86■■■□□ 2.37
FCHO1-236ENST00000602111 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
FCHO1-236ENST00000602111 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa29.73■■■□□ 2.35
FCHO1-236ENST00000602111 SCRIBQ14160 1630 aa29.71■■■□□ 2.35
FCHO1-236ENST00000602111 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
FCHO1-236ENST00000602111 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa29.5■■■□□ 2.31
FCHO1-236ENST00000602111 CUX2O14529 1486 aa28.93■■■□□ 2.22
FCHO1-236ENST00000602111 ERCC6Q03468 1493 aa28.83■■■□□ 2.21
FCHO1-236ENST00000602111 NCAPD3P42695 1498 aa28.5■■■□□ 2.15
FCHO1-236ENST00000602111 NESP48681 1621 aa28.43■■■□□ 2.14
FCHO1-236ENST00000602111 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa28.36■■■□□ 2.13
FCHO1-236ENST00000602111 TRIM41Q8WV44 630 aa28.28■■■□□ 2.12
FCHO1-236ENST00000602111 HMGXB3Q12766 1538 aa28.27■■■□□ 2.12
FCHO1-236ENST00000602111 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
FCHO1-236ENST00000602111 SMARCA2P51531 1590 aa28.24■■■□□ 2.11
FCHO1-236ENST00000602111 SMARCA4P51532 1647 aa28.18■■■□□ 2.1
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FCHO1-236ENST00000602111 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.04■■■□□ 2.08
FCHO1-236ENST00000602111 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.02■■■□□ 2.08
FCHO1-236ENST00000602111 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
FCHO1-236ENST00000602111 PDS5BQ9NTI5 1447 aa27.86■■■□□ 2.05
FCHO1-236ENST00000602111 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.83■■■□□ 2.05
FCHO1-236ENST00000602111 MRC2Q9UBG0 1479 aa27.73■■■□□ 2.03
FCHO1-236ENST00000602111 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.69■■■□□ 2.02
FCHO1-236ENST00000602111 WDR62O43379 1518 aa27.67■■■□□ 2.02
FCHO1-236ENST00000602111 CADPSQ9ULU8 1353 aa27.62■■■□□ 2.01
FCHO1-236ENST00000602111 CEP164Q9UPV0 1460 aa27.48■■□□□ 1.99
FCHO1-236ENST00000602111 OSCARQ8IYS5 282 aa27.47■■□□□ 1.99
FCHO1-236ENST00000602111 FANCD2Q9BXW9 1451 aa27.38■■□□□ 1.97
FCHO1-236ENST00000602111 WIZO95785 1651 aa27.35■■□□□ 1.97
FCHO1-236ENST00000602111 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-236ENST00000602111 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-236ENST00000602111 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.3■■□□□ 1.96
FCHO1-236ENST00000602111 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
FCHO1-236ENST00000602111 CFTRP13569 1480 aa27.16■■□□□ 1.94
FCHO1-236ENST00000602111 ARHGEF11O15085 1522 aa27.11■■□□□ 1.93
FCHO1-236ENST00000602111 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
FCHO1-236ENST00000602111 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.95■■□□□ 1.9
FCHO1-236ENST00000602111 TRHP20396 242 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
FCHO1-236ENST00000602111 IFT140Q96RY7 1462 aa26.92■■□□□ 1.9
FCHO1-236ENST00000602111 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.91■■□□□ 1.9
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FCHO1-236ENST00000602111 ARAP1Q96P48 1450 aa26.81■■□□□ 1.88
FCHO1-236ENST00000602111 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
FCHO1-236ENST00000602111 CHD1O14646 1710 aa26.8■■□□□ 1.88
FCHO1-236ENST00000602111 TOPBP1Q92547 1522 aa26.77■■□□□ 1.88
FCHO1-236ENST00000602111 FBLN2P98095 1184 aa26.67■■□□□ 1.86
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FCHO1-236ENST00000602111 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.6■■□□□ 1.85
FCHO1-236ENST00000602111 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
FCHO1-236ENST00000602111 ABCC8Q09428 1581 aa26.57■■□□□ 1.84
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FCHO1-236ENST00000602111 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.41■■□□□ 1.82
FCHO1-236ENST00000602111 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa26.41■■□□□ 1.82
FCHO1-236ENST00000602111 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.39■■□□□ 1.82
FCHO1-236ENST00000602111 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
FCHO1-236ENST00000602111 SYNJ1O43426 1573 aa26.33■■□□□ 1.81
FCHO1-236ENST00000602111 SOGA1O94964 1423 aa26.29■■□□□ 1.8
FCHO1-236ENST00000602111 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
FCHO1-236ENST00000602111 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
FCHO1-236ENST00000602111 FGD5Q6ZNL6 1462 aa26.21■■□□□ 1.79
FCHO1-236ENST00000602111 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.19■■□□□ 1.78
FCHO1-236ENST00000602111 WDR97A6NE52 1622 aa26.18■■□□□ 1.78
FCHO1-236ENST00000602111 SYNJ2O15056 1496 aa26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-236ENST00000602111 GRIN2BQ13224 1484 aa26.16■■□□□ 1.78
FCHO1-236ENST00000602111 PBRM1Q86U86 1689 aa26.07■■□□□ 1.76
FCHO1-236ENST00000602111 CUX1P39880 1505 aa26.06■■□□□ 1.76
FCHO1-236ENST00000602111 ERCC6L2Q5T890 1561 aa26.02■■□□□ 1.76
FCHO1-236ENST00000602111 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.88■■□□□ 1.73
FCHO1-236ENST00000602111 CEP170Q5SW79 1584 aa25.86■■□□□ 1.73
FCHO1-236ENST00000602111 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-236ENST00000602111 GRIN2AQ12879 1464 aa25.84■■□□□ 1.73
FCHO1-236ENST00000602111 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.8■■□□□ 1.72
FCHO1-236ENST00000602111 ADAMTS12P58397 1594 aa25.77■■□□□ 1.72
FCHO1-236ENST00000602111 NUP160Q12769 1436 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-236ENST00000602111 SHROOM2Q13796 1616 aa25.74■■□□□ 1.71
FCHO1-236ENST00000602111 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-236ENST00000602111 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
FCHO1-236ENST00000602111 FHAD1B1AJZ9 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
FCHO1-236ENST00000602111 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.69
FCHO1-236ENST00000602111 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-236ENST00000602111 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.56■■□□□ 1.68
FCHO1-236ENST00000602111 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.55■■□□□ 1.68
FCHO1-236ENST00000602111 DIP2BQ9P265 1576 aa25.53■■□□□ 1.68
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