RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473604.2

TOR1A-203, Transcript of torsin family 1 member A, humanhuman

TSL 5

Gene TOR1A, Length 1,055 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOR1A-203ENST00000473604 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50■■■■■ 5.59
TOR1A-203ENST00000473604 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.65■■■■■ 4.74
TOR1A-203ENST00000473604 ABCC9O60706 1549 aa44.03■■■■■ 4.64
TOR1A-203ENST00000473604 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.18■■■■■ 4.34
TOR1A-203ENST00000473604 NACADO15069 1562 aa42.03■■■■■ 4.32
TOR1A-203ENST00000473604 DCAF8L2P0C7V8 631 aa41.94■■■■■ 4.3
TOR1A-203ENST00000473604 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.61■■■■■ 4.25
TOR1A-203ENST00000473604 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
TOR1A-203ENST00000473604 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.35■■■■■ 4.21
TOR1A-203ENST00000473604 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.32■■■■■ 4.2
TOR1A-203ENST00000473604 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.06■■■■■ 4.16
TOR1A-203ENST00000473604 BICRAQ9NZM4 1560 aa40.94■■■■■ 4.14
TOR1A-203ENST00000473604 SCRIBQ14160 1630 aa40.73■■■■■ 4.11
TOR1A-203ENST00000473604 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.72■■■■■ 4.11
TOR1A-203ENST00000473604 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.39■■■■■ 4.06
TOR1A-203ENST00000473604 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP39.87■■■■□ 3.97
TOR1A-203ENST00000473604 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa39.83■■■■□ 3.97
TOR1A-203ENST00000473604 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.58■■■■□ 3.93
TOR1A-203ENST00000473604 SMARCA4P51532 1647 aa38.91■■■■□ 3.82
TOR1A-203ENST00000473604 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.78■■■■□ 3.8
TOR1A-203ENST00000473604 NCAPD3P42695 1498 aa38.75■■■■□ 3.79
TOR1A-203ENST00000473604 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa38.74■■■■□ 3.79
TOR1A-203ENST00000473604 SMARCA2P51531 1590 aa38.7■■■■□ 3.79
TOR1A-203ENST00000473604 HMGXB3Q12766 1538 aa38.57■■■■□ 3.76
TOR1A-203ENST00000473604 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.54■■■■□ 3.76
TOR1A-203ENST00000473604 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.49■■■■□ 3.75
TOR1A-203ENST00000473604 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.42■■■■□ 3.74
TOR1A-203ENST00000473604 WIZO95785 1651 aa38.16■■■■□ 3.7
TOR1A-203ENST00000473604 NESP48681 1621 aa38■■■■□ 3.67
TOR1A-203ENST00000473604 ERCC6Q03468 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
TOR1A-203ENST00000473604 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.94■■■■□ 3.66
TOR1A-203ENST00000473604 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa37.84■■■■□ 3.65
TOR1A-203ENST00000473604 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
TOR1A-203ENST00000473604 CUX2O14529 1486 aa37.67■■■■□ 3.62
TOR1A-203ENST00000473604 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.61■■■■□ 3.61
TOR1A-203ENST00000473604 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.61■■■■□ 3.61
TOR1A-203ENST00000473604 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.55■■■■□ 3.6
TOR1A-203ENST00000473604 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.51■■■■□ 3.6
TOR1A-203ENST00000473604 CFTRP13569 1480 aa37.32■■■■□ 3.56
TOR1A-203ENST00000473604 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.23■■■■□ 3.55
TOR1A-203ENST00000473604 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.21■■■■□ 3.55
TOR1A-203ENST00000473604 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.21■■■■□ 3.55
TOR1A-203ENST00000473604 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.2■■■■□ 3.54
TOR1A-203ENST00000473604 PRDM2Q13029 1718 aa37.15■■■■□ 3.54
TOR1A-203ENST00000473604 WDR62O43379 1518 aa37.11■■■■□ 3.53
TOR1A-203ENST00000473604 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.93■■■■□ 3.5
TOR1A-203ENST00000473604 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
TOR1A-203ENST00000473604 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP36.73■■■■□ 3.47
TOR1A-203ENST00000473604 TOPBP1Q92547 1522 aa36.59■■■■□ 3.45
TOR1A-203ENST00000473604 ABCC8Q09428 1581 aa36.53■■■■□ 3.44
TOR1A-203ENST00000473604 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.52■■■■□ 3.44
TOR1A-203ENST00000473604 IFT140Q96RY7 1462 aa36.41■■■■□ 3.42
TOR1A-203ENST00000473604 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.32■■■■□ 3.4
TOR1A-203ENST00000473604 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.24■■■■□ 3.39
TOR1A-203ENST00000473604 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.24■■■■□ 3.39
TOR1A-203ENST00000473604 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.19■■■■□ 3.38
TOR1A-203ENST00000473604 CUX1P39880 1505 aa36.18■■■■□ 3.38
TOR1A-203ENST00000473604 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.11■■■■□ 3.37
TOR1A-203ENST00000473604 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.1■■■■□ 3.37
TOR1A-203ENST00000473604 SOGA1O94964 1423 aa36.08■■■■□ 3.37
TOR1A-203ENST00000473604 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.06■■■■□ 3.367e-10■■■■■ 28.7
TOR1A-203ENST00000473604 OSCARQ8IYS5 282 aa36.03■■■■□ 3.36
TOR1A-203ENST00000473604 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP35.92■■■■□ 3.34
TOR1A-203ENST00000473604 WDR97A6NE52 1622 aa35.89■■■■□ 3.34
TOR1A-203ENST00000473604 CHD1O14646 1710 aa35.86■■■■□ 3.33
TOR1A-203ENST00000473604 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.8■■■■□ 3.32
TOR1A-203ENST00000473604 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.78■■■■□ 3.32
TOR1A-203ENST00000473604 TOP2BQ02880 1626 aa35.78■■■■□ 3.32
TOR1A-203ENST00000473604 SYNJ1O43426 1573 aa35.76■■■■□ 3.32
TOR1A-203ENST00000473604 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.73■■■■□ 3.31
TOR1A-203ENST00000473604 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa35.72■■■■□ 3.31
TOR1A-203ENST00000473604 FBLN2P98095 1184 aa35.7■■■■□ 3.31
TOR1A-203ENST00000473604 PBRM1Q86U86 1689 aa35.7■■■■□ 3.31
TOR1A-203ENST00000473604 GRIN2BQ13224 1484 aa35.69■■■■□ 3.3
TOR1A-203ENST00000473604 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.67■■■■□ 3.3
TOR1A-203ENST00000473604 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.65■■■■□ 3.3
TOR1A-203ENST00000473604 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.64■■■■□ 3.3
TOR1A-203ENST00000473604 TRIM41Q8WV44 630 aa35.61■■■■□ 3.29
TOR1A-203ENST00000473604 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
TOR1A-203ENST00000473604 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
TOR1A-203ENST00000473604 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.57■■■■□ 3.29
TOR1A-203ENST00000473604 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.52■■■■□ 3.28
TOR1A-203ENST00000473604 SYNJ2O15056 1496 aa35.5■■■■□ 3.27
TOR1A-203ENST00000473604 ARHGEF11O15085 1522 aa35.49■■■■□ 3.27
TOR1A-203ENST00000473604 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.37■■■■□ 3.25
TOR1A-203ENST00000473604 ADAMTS12P58397 1594 aa35.34■■■■□ 3.25
TOR1A-203ENST00000473604 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.29■■■■□ 3.24
TOR1A-203ENST00000473604 GRIN2AQ12879 1464 aa35.24■■■■□ 3.23
TOR1A-203ENST00000473604 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.22■■■■□ 3.23
TOR1A-203ENST00000473604 ARAP1Q96P48 1450 aa35.18■■■■□ 3.22
TOR1A-203ENST00000473604 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.17■■■■□ 3.22
TOR1A-203ENST00000473604 CEP170Q5SW79 1584 aa35.12■■■■□ 3.21
TOR1A-203ENST00000473604 NUP160Q12769 1436 aa35.08■■■■□ 3.21
TOR1A-203ENST00000473604 KIF27Q86VH2 1401 aa35.06■■■■□ 3.2
TOR1A-203ENST00000473604 IGF1RP08069 1367 aa34.96■■■■□ 3.19
TOR1A-203ENST00000473604 CUL7Q14999 1698 aa34.94■■■■□ 3.18
TOR1A-203ENST00000473604 SHROOM2Q13796 1616 aa34.92■■■■□ 3.18
TOR1A-203ENST00000473604 ERCC6L2Q5T890 1561 aa34.89■■■■□ 3.18
TOR1A-203ENST00000473604 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa34.82■■■■□ 3.16
TOR1A-203ENST00000473604 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.1 ms