RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596951.5

FCHO1-218, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 2,979 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-218ENST00000596951 NISCHQ9Y2I1 1504 aa24.01■■□□□ 1.43
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa20.7■□□□□ 0.9
FCHO1-218ENST00000596951 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa20.39■□□□□ 0.85
FCHO1-218ENST00000596951 DCAF8L2P0C7V8 631 aa20.3■□□□□ 0.84
FCHO1-218ENST00000596951 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
FCHO1-218ENST00000596951 ABCC9O60706 1549 aa20.02■□□□□ 0.8
FCHO1-218ENST00000596951 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
FCHO1-218ENST00000596951 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa19.64■□□□□ 0.74
FCHO1-218ENST00000596951 NACADO15069 1562 aa19.37■□□□□ 0.69
FCHO1-218ENST00000596951 MYO15BQ96JP2 1530 aa19.37■□□□□ 0.69
FCHO1-218ENST00000596951 SCRIBQ14160 1630 aa19.36■□□□□ 0.69
FCHO1-218ENST00000596951 HRCP23327 699 aa19.35■□□□□ 0.69
FCHO1-218ENST00000596951 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.25■□□□□ 0.67
FCHO1-218ENST00000596951 CHIC1Q5VXU3 224 aa19.23■□□□□ 0.67
FCHO1-218ENST00000596951 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP19.04■□□□□ 0.64
FCHO1-218ENST00000596951 PCGF6Q9BYE7 350 aa19.01■□□□□ 0.63
FCHO1-218ENST00000596951 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
FCHO1-218ENST00000596951 UNC13AQ9UPW8 1703 aa18.89■□□□□ 0.61
FCHO1-218ENST00000596951 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa18.87■□□□□ 0.61
FCHO1-218ENST00000596951 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.84■□□□□ 0.61
FCHO1-218ENST00000596951 BICRAQ9NZM4 1560 aa18.77■□□□□ 0.59
FCHO1-218ENST00000596951 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
FCHO1-218ENST00000596951 MROH2BQ7Z745 1585 aa18.65■□□□□ 0.58
FCHO1-218ENST00000596951 EHMT2Q96KQ7 1210 aa18.59■□□□□ 0.57
FCHO1-218ENST00000596951 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
FCHO1-218ENST00000596951 WIZO95785 1651 aa18.48■□□□□ 0.55
FCHO1-218ENST00000596951 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
FCHO1-218ENST00000596951 TRIM41Q8WV44 630 aa18.44■□□□□ 0.54
FCHO1-218ENST00000596951 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-218ENST00000596951 SMARCA4P51532 1647 aa18.43■□□□□ 0.54
FCHO1-218ENST00000596951 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
FCHO1-218ENST00000596951 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
FCHO1-218ENST00000596951 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
FCHO1-218ENST00000596951 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-218ENST00000596951 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa18.2■□□□□ 0.5
FCHO1-218ENST00000596951 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
FCHO1-218ENST00000596951 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.12■□□□□ 0.49
FCHO1-218ENST00000596951 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-218ENST00000596951 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.09■□□□□ 0.49
FCHO1-218ENST00000596951 SMARCA2P51531 1590 aa18.06■□□□□ 0.48
FCHO1-218ENST00000596951 NCAPD3P42695 1498 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-218ENST00000596951 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa17.97■□□□□ 0.47
FCHO1-218ENST00000596951 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.46
FCHO1-218ENST00000596951 DNAJC5BQ9UF47 199 aa17.92■□□□□ 0.46
FCHO1-218ENST00000596951 HMGXB3Q12766 1538 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-218ENST00000596951 ABCC8Q09428 1581 aa17.85■□□□□ 0.45
FCHO1-218ENST00000596951 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
FCHO1-218ENST00000596951 NEUROD1Q13562 356 aa17.79■□□□□ 0.44
FCHO1-218ENST00000596951 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
FCHO1-218ENST00000596951 SOGA1O94964 1423 aa17.7■□□□□ 0.42
FCHO1-218ENST00000596951 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa17.66■□□□□ 0.42
FCHO1-218ENST00000596951 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa17.65■□□□□ 0.42
FCHO1-218ENST00000596951 UBTFP17480 764 aaKnown RBP17.63■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 MYT1Q01538 1121 aa17.63■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.61■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 CFTRP13569 1480 aa17.6■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP17.6■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.6■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 NESP48681 1621 aa17.59■□□□□ 0.41
FCHO1-218ENST00000596951 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP17.57■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 CEP162Q5TB80 1403 aa17.55■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP17.55■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 CSRNP3Q8WYN3 585 aa17.54■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 SYNJ1O43426 1573 aa17.52■□□□□ 0.4
FCHO1-218ENST00000596951 TNIKQ9UKE5 1360 aa17.41■□□□□ 0.38
FCHO1-218ENST00000596951 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.41■□□□□ 0.38
FCHO1-218ENST00000596951 CUX1P39880 1505 aa17.41■□□□□ 0.38
FCHO1-218ENST00000596951 TOP2BQ02880 1626 aa17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-218ENST00000596951 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
FCHO1-218ENST00000596951 GOLGA3Q08378 1498 aa17.32■□□□□ 0.36
FCHO1-218ENST00000596951 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.29■□□□□ 0.36
FCHO1-218ENST00000596951 EEA1Q15075 1411 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-218ENST00000596951 PRDM2Q13029 1718 aa17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-218ENST00000596951 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
FCHO1-218ENST00000596951 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 PDS5BQ9NTI5 1447 aa17.26■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CEP164Q9UPV0 1460 aa17.25■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 FGD5Q6ZNL6 1462 aa17.23■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 CLIP1P30622 1438 aa17.22■□□□□ 0.35
FCHO1-218ENST00000596951 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 TOPBP1Q92547 1522 aa17.2■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa17.19■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 MIER1Q8N108 512 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 CUX2O14529 1486 aa17.16■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.14■□□□□ 0.34
FCHO1-218ENST00000596951 DNMBPQ6XZF7 1577 aa17.14■□□□□ 0.33
FCHO1-218ENST00000596951 APLP2Q06481 763 aa17.13■□□□□ 0.33
FCHO1-218ENST00000596951 KIF27Q86VH2 1401 aa17.12■□□□□ 0.33
FCHO1-218ENST00000596951 ERCC6Q03468 1493 aa17.09■□□□□ 0.33
FCHO1-218ENST00000596951 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP17.08■□□□□ 0.32
FCHO1-218ENST00000596951 KIF21BO75037 1637 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-218ENST00000596951 VPS8Q8N3P4 1428 aa17.07■□□□□ 0.32
FCHO1-218ENST00000596951 IGF1RP08069 1367 aa17.06■□□□□ 0.32
FCHO1-218ENST00000596951 MRC2Q9UBG0 1479 aa17.02■□□□□ 0.32
FCHO1-218ENST00000596951 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP17.01■□□□□ 0.31
FCHO1-218ENST00000596951 PRXQ9BXM0 1461 aa16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms