Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZB2

FAM120A, Constitutive coactivator of PPAR-gamma-like protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM120AQ9NZB2 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.699e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 TYK2-213ENST00000529739 842 ntTSL 218.86■□□□□ 0.619e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 PDLIM7-208ENST00000493815 1686 ntTSL 1 (best)18.82■□□□□ 0.69e-8■■■■■ 27
FAM120AQ9NZB2 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.69e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.189e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.169e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.049e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.139e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 ZC3H8-201ENST00000272570 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 SSX2IP-201ENST00000342203 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.299e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 ELOVL5-202ENST00000370913 580 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.49e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 TYK2-212ENST00000529422 622 ntTSL 512.2□□□□□ -0.469e-8■■■■■ 27
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FAM120AQ9NZB2 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.69e-7■■■■■ 26.8
FAM120AQ9NZB2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.419e-7■■■■■ 26.8
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FAM120AQ9NZB2 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 26.8
FAM120AQ9NZB2 CCDC57-205ENST00000392346 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.431e-6■■■■■ 26.8
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FAM120AQ9NZB2 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.112e-14■■■■□ 26.7
FAM120AQ9NZB2 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.12e-14■■■■□ 26.7
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FAM120AQ9NZB2 SUMO1-202ENST00000392245 1071 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.272e-14■■■■□ 26.7
FAM120AQ9NZB2 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC8.18□□□□□ -1.12e-14■■■■□ 26.7
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