RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409627.6

SUMO1-208, Transcript of small ubiquitin-like modifier 1, human

TSL 3

Gene SUMO1, Length 722 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUMO1-208	ENST00000409627	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		39.64	■■■■□ 3.94
SUMO1-208	ENST00000409627	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		35.12	■■■■□ 3.21
SUMO1-208	ENST00000409627	ABCC9	O60706	1549 aa		33.76	■■■■□ 3
SUMO1-208	ENST00000409627	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	33.14	■■■□□ 2.9
SUMO1-208	ENST00000409627	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		32.87	■■■□□ 2.85
SUMO1-208	ENST00000409627	NACAD	O15069	1562 aa		32.84	■■■□□ 2.85
SUMO1-208	ENST00000409627	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		32.83	■■■□□ 2.85
SUMO1-208	ENST00000409627	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SUMO1-208	ENST00000409627	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		32.76	■■■□□ 2.84
SUMO1-208	ENST00000409627	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SUMO1-208	ENST00000409627	SCRIB	Q14160	1630 aa		32	■■■□□ 2.71
SUMO1-208	ENST00000409627	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SUMO1-208	ENST00000409627	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	31.56	■■■□□ 2.64
SUMO1-208	ENST00000409627	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		31.5	■■■□□ 2.63
SUMO1-208	ENST00000409627	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	30.87	■■■□□ 2.53
SUMO1-208	ENST00000409627	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		30.79	■■■□□ 2.52
SUMO1-208	ENST00000409627	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	30.71	■■■□□ 2.51
SUMO1-208	ENST00000409627	SMARCA4	P51532	1647 aa		30.69	■■■□□ 2.5
SUMO1-208	ENST00000409627	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		30.62	■■■□□ 2.49
SUMO1-208	ENST00000409627	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		30.54	■■■□□ 2.48
SUMO1-208	ENST00000409627	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		30.48	■■■□□ 2.47
SUMO1-208	ENST00000409627	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		30.4	■■■□□ 2.46
SUMO1-208	ENST00000409627	SMARCA2	P51531	1590 aa		30.37	■■■□□ 2.45
SUMO1-208	ENST00000409627	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	30.35	■■■□□ 2.45
SUMO1-208	ENST00000409627	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		30.35	■■■□□ 2.45
SUMO1-208	ENST00000409627	WIZ	O95785	1651 aa		30.27	■■■□□ 2.44
SUMO1-208	ENST00000409627	NCAPD3	P42695	1498 aa		30.26	■■■□□ 2.44
SUMO1-208	ENST00000409627	HMGXB3	Q12766	1538 aa		30.22	■■■□□ 2.43
SUMO1-208	ENST00000409627	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	30.13	■■■□□ 2.41
SUMO1-208	ENST00000409627	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	29.98	■■■□□ 2.39
SUMO1-208	ENST00000409627	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	29.85	■■■□□ 2.37
SUMO1-208	ENST00000409627	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		29.58	■■■□□ 2.33
SUMO1-208	ENST00000409627	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		29.43	■■■□□ 2.3
SUMO1-208	ENST00000409627	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		29.39	■■■□□ 2.29
SUMO1-208	ENST00000409627	NES	P48681	1621 aa		29.37	■■■□□ 2.29
SUMO1-208	ENST00000409627	CFTR	P13569	1480 aa		29.34	■■■□□ 2.29
SUMO1-208	ENST00000409627	PRDM2	Q13029	1718 aa		29.28	■■■□□ 2.28
SUMO1-208	ENST00000409627	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		29.16	■■■□□ 2.26
SUMO1-208	ENST00000409627	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		29.12	■■■□□ 2.25
SUMO1-208	ENST00000409627	ERCC6	Q03468	1493 aa		29.07	■■■□□ 2.24
SUMO1-208	ENST00000409627	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		29.06	■■■□□ 2.24
SUMO1-208	ENST00000409627	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		28.99	■■■□□ 2.23
SUMO1-208	ENST00000409627	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	28.89	■■■□□ 2.22
SUMO1-208	ENST00000409627	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		28.85	■■■□□ 2.21
SUMO1-208	ENST00000409627	WDR62	O43379	1518 aa		28.78	■■■□□ 2.2
SUMO1-208	ENST00000409627	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	28.75	■■■□□ 2.19
SUMO1-208	ENST00000409627	ABCC8	Q09428	1581 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SUMO1-208	ENST00000409627	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		28.71	■■■□□ 2.19
SUMO1-208	ENST00000409627	TOPBP1	Q92547	1522 aa		28.67	■■■□□ 2.18
SUMO1-208	ENST00000409627	CUX1	P39880	1505 aa		28.64	■■■□□ 2.17
SUMO1-208	ENST00000409627	CUX2	O14529	1486 aa		28.63	■■■□□ 2.17
SUMO1-208	ENST00000409627	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	28.6	■■■□□ 2.17
SUMO1-208	ENST00000409627	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		28.58	■■■□□ 2.17
SUMO1-208	ENST00000409627	TOP2B	Q02880	1626 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SUMO1-208	ENST00000409627	SYNJ1	O43426	1573 aa		28.55	■■■□□ 2.16
SUMO1-208	ENST00000409627	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	28.46	■■■□□ 2.15
SUMO1-208	ENST00000409627	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		28.46	■■■□□ 2.15
SUMO1-208	ENST00000409627	IFT140	Q96RY7	1462 aa		28.37	■■■□□ 2.13
SUMO1-208	ENST00000409627	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	28.35	■■■□□ 2.13
SUMO1-208	ENST00000409627	SOGA1	O94964	1423 aa		28.31	■■■□□ 2.12
SUMO1-208	ENST00000409627	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SUMO1-208	ENST00000409627	WDR97	A6NE52	1622 aa		28.29	■■■□□ 2.12
SUMO1-208	ENST00000409627	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		28.22	■■■□□ 2.11
SUMO1-208	ENST00000409627	TRIM41	Q8WV44	630 aa		28.2	■■■□□ 2.1
SUMO1-208	ENST00000409627	CHIC1	Q5VXU3	224 aa		28.18	■■■□□ 2.1
SUMO1-208	ENST00000409627	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	28.17	■■■□□ 2.1
SUMO1-208	ENST00000409627	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
SUMO1-208	ENST00000409627	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		28.1	■■■□□ 2.09
SUMO1-208	ENST00000409627	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	28.07	■■■□□ 2.08
SUMO1-208	ENST00000409627	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	28.05	■■■□□ 2.08
SUMO1-208	ENST00000409627	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		28.02	■■■□□ 2.08
SUMO1-208	ENST00000409627	PBRM1	Q86U86	1689 aa		28.01	■■■□□ 2.07
SUMO1-208	ENST00000409627	KIF27	Q86VH2	1401 aa		27.98	■■■□□ 2.07
SUMO1-208	ENST00000409627	GRIN2B	Q13224	1484 aa		27.95	■■■□□ 2.07
SUMO1-208	ENST00000409627	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		27.9	■■■□□ 2.06
SUMO1-208	ENST00000409627	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SUMO1-208	ENST00000409627	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SUMO1-208	ENST00000409627	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SUMO1-208	ENST00000409627	ADAMTS12	P58397	1594 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SUMO1-208	ENST00000409627	EEA1	Q15075	1411 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SUMO1-208	ENST00000409627	CUL7	Q14999	1698 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SUMO1-208	ENST00000409627	IGF1R	P08069	1367 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SUMO1-208	ENST00000409627	SYNJ2	O15056	1496 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SUMO1-208	ENST00000409627	CHD1	O14646	1710 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SUMO1-208	ENST00000409627	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SUMO1-208	ENST00000409627	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		27.62	■■■□□ 2.01
SUMO1-208	ENST00000409627	GRIN2A	Q12879	1464 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SUMO1-208	ENST00000409627	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	27.6	■■■□□ 2.01
SUMO1-208	ENST00000409627	CSRNP3	Q8WYN3	585 aa		27.6	■■■□□ 2.01
SUMO1-208	ENST00000409627	PRX	Q9BXM0	1461 aa		27.57	■■■□□ 2
SUMO1-208	ENST00000409627	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	27.57	■■■□□ 2
SUMO1-208	ENST00000409627	FBLN2	P98095	1184 aa		27.56	■■■□□ 2
SUMO1-208	ENST00000409627	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		27.54	■■■□□ 2
SUMO1-208	ENST00000409627	KIF21B	O75037	1637 aa		27.5	■■□□□ 1.99
SUMO1-208	ENST00000409627	NUP160	Q12769	1436 aa		27.47	■■□□□ 1.99
SUMO1-208	ENST00000409627	CEP170	Q5SW79	1584 aa		27.46	■■□□□ 1.99
SUMO1-208	ENST00000409627	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		27.45	■■□□□ 1.98
SUMO1-208	ENST00000409627	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		27.41	■■□□□ 1.98
SUMO1-208	ENST00000409627	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		27.35	■■□□□ 1.97
SUMO1-208	ENST00000409627	GOLGA3	Q08378	1498 aa		27.33	■■□□□ 1.97

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