Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 SLC39A3-205ENST00000589363 524 ntTSL 322.25■■□□□ 1.156e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.036e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SLC39A3-204ENST00000589166 491 ntTSL 211.78□□□□□ -0.526e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMED2-202ENST00000438031 603 ntTSL 430.6■■■□□ 2.493e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.943e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMED2-204ENST00000543425 1350 ntTSL 315.52■□□□□ 0.083e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMED2-203ENST00000509052 1975 ntTSL 2 BASIC8.06□□□□□ -1.123e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.351e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.081e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-204ENST00000557961 591 ntTSL 227.07■■□□□ 1.921e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.191e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.171e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-220ENST00000559930 678 ntTSL 421.35■■□□□ 1.011e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-210ENST00000558893 1209 ntTSL 1 (best)14.16□□□□□ -0.141e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-208ENST00000558746 874 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.241e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-209ENST00000558830 616 ntTSL 38.38□□□□□ -1.071e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-218ENST00000559697 551 ntTSL 57.02□□□□□ -1.291e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-205ENST00000558502 855 ntTSL 3 BASIC6.48□□□□□ -1.371e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-206ENST00000558522 1074 ntTSL 25.39□□□□□ -1.551e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-223ENST00000561171 933 ntTSL 25.39□□□□□ -1.551e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MORF4L1-216ENST00000559619 448 ntTSL 24.93□□□□□ -1.621e-9■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.073e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 221.7■■□□□ 1.063e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 220.06■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 420.06■□□□□ 0.83e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.733e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.73e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.643e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.593e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.463e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 317.64■□□□□ 0.413e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 217.57■□□□□ 0.43e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMEM38B-202ENST00000374692 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.141e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 TMEM38B-203ENST00000434214 502 ntTSL 212□□□□□ -0.491e-6■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-201ENST00000358161 7794 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.621e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-228ENST00000635853 5870 ntTSL 510.61□□□□□ -0.711e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-210ENST00000625282 4102 ntTSL 210.38□□□□□ -0.751e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-202ENST00000372731 7889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.781e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-203ENST00000372739 7868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.81e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-223ENST00000630866 7498 ntTSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.891e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 SPTAN1-222ENST00000630804 7812 ntTSL 5 BASIC8.79□□□□□ -11e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 ZNF672-204ENST00000502697 559 ntTSL 516.03■□□□□ 0.162e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 ZNF672-203ENST00000428515 930 ntTSL 215.66■□□□□ 0.12e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 ZNF672-202ENST00000423362 883 ntTSL 514.91□□□□□ -0.022e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 ZNF672-207ENST00000515369 500 ntTSL 513.75□□□□□ -0.212e-7■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-202ENST00000462646 335 ntTSL 321.84■■□□□ 1.092e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.032e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-NBL1-202ENST00000602384 999 ntTSL 520.46■□□□□ 0.872e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-NBL1-203ENST00000602450 590 ntTSL 219.83■□□□□ 0.772e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-NBL1-201ENST00000602293 820 ntTSL 317.06■□□□□ 0.322e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-203ENST00000467029 583 ntTSL 216.74■□□□□ 0.272e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-209ENST00000498642 669 ntTSL 216.72■□□□□ 0.272e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-205ENST00000481464 657 ntTSL 315.65■□□□□ 0.12e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-207ENST00000486890 677 ntTSL 314.46□□□□□ -0.092e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-201ENST00000322753 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.292e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-210ENST00000617872 3678 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.32e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MINOS1-206ENST00000485362 438 ntTSL 26.73□□□□□ -1.332e-10■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MLLT6-209ENST00000620482 1556 ntTSL 1 (best)20.51■□□□□ 0.872e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.662e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MLLT6-207ENST00000618652 624 ntTSL 317.19■□□□□ 0.342e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.092e-12■■□□□ 13.2
FTOQ9C0B1 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.263e-6■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.273e-6■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 NEDD8-MDP1-203ENST00000604306 681 ntTSL 514.06□□□□□ -0.168e-11■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 NEDD8-MDP1-201ENST00000530579 471 ntTSL 29.7□□□□□ -0.868e-11■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.465e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.495e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.225e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-203ENST00000426886 2618 ntTSL 1 (best)14.1□□□□□ -0.155e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-201ENST00000417239 684 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.735e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SMIM12-204ENST00000446026 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.745e-8■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.03■■□□□ 1.445e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 LINC01006-208ENST00000624071 651 nt21.52■■□□□ 1.045e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.255e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.225e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC8.93□□□□□ -0.985e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 520.42■□□□□ 0.862e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.838e-14■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-209ENST00000599704 753 ntTSL 316.78■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 ABCE1-202ENST00000502586 786 ntTSL 516.77■□□□□ 0.282e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-208ENST00000599255 667 ntTSL 316.42■□□□□ 0.222e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-204ENST00000596315 761 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-207ENST00000597529 437 ntTSL 212.03□□□□□ -0.482e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 ABCE1-207ENST00000507193 2146 ntTSL 1 (best)11.59□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-201ENST00000270221 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.562e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 EMP3-203ENST00000594198 263 ntTSL 211.48□□□□□ -0.572e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 ABCE1-201ENST00000296577 3921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.652e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 ABCE1-206ENST00000506506 421 ntTSL 310.39□□□□□ -0.752e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 ABCE1-203ENST00000502803 782 ntTSL 510.03□□□□□ -0.82e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 DNAJC19-205ENST00000479269 610 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.822e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.152e-7■■□□□ 13.1
FTOQ9C0B1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.747e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.27e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.957e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.417e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-212ENST00000497484 990 ntTSL 217.34■□□□□ 0.377e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.027e-7■■□□□ 13
FTOQ9C0B1 MAGED2-205ENST00000375060 1798 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.027e-7■■□□□ 13
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