RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438031.2

TMED2-202, Transcript of transmembrane p24 trafficking protein 2, humanhuman

TSL 4

Gene TMED2, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED2-202ENST00000438031 NISCHQ9Y2I1 1504 aa65.64■■■■■ 8.1
TMED2-202ENST00000438031 ABCC9O60706 1549 aa59.03■■■■■ 7.04
TMED2-202ENST00000438031 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.85■■■■■ 7.01
TMED2-202ENST00000438031 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.12■■■■■ 6.57
TMED2-202ENST00000438031 NACADO15069 1562 aa55.72■■■■■ 6.51
TMED2-202ENST00000438031 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.6■■■■■ 6.49
TMED2-202ENST00000438031 DNAJC5BQ9UF47 199 aa55.45■■■■■ 6.47
TMED2-202ENST00000438031 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP55.01■■■■■ 6.4
TMED2-202ENST00000438031 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.91■■■■■ 6.38
TMED2-202ENST00000438031 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.76■■■■■ 6.36
TMED2-202ENST00000438031 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.45■■■■■ 6.31
TMED2-202ENST00000438031 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP54.36■■■■■ 6.29
TMED2-202ENST00000438031 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.19■■■■■ 6.27
TMED2-202ENST00000438031 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.71■■■■■ 6.19
TMED2-202ENST00000438031 SCRIBQ14160 1630 aa53.68■■■■■ 6.18
TMED2-202ENST00000438031 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.27■■■■■ 6.12
TMED2-202ENST00000438031 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.17■■■■■ 6.1
TMED2-202ENST00000438031 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.14■■■■■ 6.1
TMED2-202ENST00000438031 NCAPD3P42695 1498 aa51.47■■■■■ 5.83
TMED2-202ENST00000438031 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.3■■■■■ 5.8
TMED2-202ENST00000438031 SMARCA4P51532 1647 aa51.19■■■■■ 5.78
TMED2-202ENST00000438031 SMARCA2P51531 1590 aa51.14■■■■■ 5.78
TMED2-202ENST00000438031 HMGXB3Q12766 1538 aa51.03■■■■■ 5.76
TMED2-202ENST00000438031 ERCC6Q03468 1493 aa50.98■■■■■ 5.75
TMED2-202ENST00000438031 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa50.98■■■■■ 5.75
TMED2-202ENST00000438031 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.95■■■■■ 5.75
TMED2-202ENST00000438031 CUX2O14529 1486 aa50.85■■■■■ 5.73
TMED2-202ENST00000438031 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.8■■■■■ 5.72
TMED2-202ENST00000438031 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.68■■■■■ 5.7
TMED2-202ENST00000438031 NESP48681 1621 aa50.67■■■■■ 5.7
TMED2-202ENST00000438031 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.58■■■■■ 5.69
TMED2-202ENST00000438031 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.28■■■■■ 5.64
TMED2-202ENST00000438031 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
TMED2-202ENST00000438031 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.06■■■■■ 5.6
TMED2-202ENST00000438031 WIZO95785 1651 aa49.95■■■■■ 5.59
TMED2-202ENST00000438031 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.95■■■■■ 5.59
TMED2-202ENST00000438031 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.92■■■■■ 5.58
TMED2-202ENST00000438031 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.59■■■■■ 5.53
TMED2-202ENST00000438031 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.54■■■■■ 5.52
TMED2-202ENST00000438031 WDR62O43379 1518 aa49.43■■■■■ 5.5
TMED2-202ENST00000438031 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.38■■■■■ 5.5
TMED2-202ENST00000438031 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.34■■■■■ 5.49
TMED2-202ENST00000438031 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP49.32■■■■■ 5.49
TMED2-202ENST00000438031 CFTRP13569 1480 aa49.31■■■■■ 5.48
TMED2-202ENST00000438031 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.92■■■■■ 5.42
TMED2-202ENST00000438031 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.81■■■■■ 5.4
TMED2-202ENST00000438031 TRIM41Q8WV44 630 aa48.76■■■■■ 5.4
TMED2-202ENST00000438031 PRDM2Q13029 1718 aa48.71■■■■■ 5.39
TMED2-202ENST00000438031 OSCARQ8IYS5 282 aa48.63■■■■■ 5.38
TMED2-202ENST00000438031 IFT140Q96RY7 1462 aa48.42■■■■■ 5.34
TMED2-202ENST00000438031 TOPBP1Q92547 1522 aa48.38■■■■■ 5.34
TMED2-202ENST00000438031 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.33■■■■■ 5.33
TMED2-202ENST00000438031 ABCC8Q09428 1581 aa48.3■■■■■ 5.32
TMED2-202ENST00000438031 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.18■■■■■ 5.3
TMED2-202ENST00000438031 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.01■■■■■ 5.28
TMED2-202ENST00000438031 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
TMED2-202ENST00000438031 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.92■■■■■ 5.261e-6■■□□□ 11.4
TMED2-202ENST00000438031 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.88■■■■■ 5.26
TMED2-202ENST00000438031 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.88■■■■■ 5.25
TMED2-202ENST00000438031 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.88■■■■■ 5.25
TMED2-202ENST00000438031 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.88■■■■■ 5.25
TMED2-202ENST00000438031 ARHGEF11O15085 1522 aa47.75■■■■■ 5.23
TMED2-202ENST00000438031 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.74■■■■■ 5.23
TMED2-202ENST00000438031 SOGA1O94964 1423 aa47.73■■■■■ 5.23
TMED2-202ENST00000438031 FBLN2P98095 1184 aa47.7■■■■■ 5.23
TMED2-202ENST00000438031 CHD1O14646 1710 aa47.66■■■■■ 5.22
TMED2-202ENST00000438031 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.64■■■■■ 5.22
TMED2-202ENST00000438031 FGD5Q6ZNL6 1462 aa47.59■■■■■ 5.21
TMED2-202ENST00000438031 CUX1P39880 1505 aa47.52■■■■■ 5.2
TMED2-202ENST00000438031 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.51■■■■■ 5.2
TMED2-202ENST00000438031 WDR97A6NE52 1622 aa47.42■■■■■ 5.18
TMED2-202ENST00000438031 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.42■■■■■ 5.18
TMED2-202ENST00000438031 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.4■■■■■ 5.18
TMED2-202ENST00000438031 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.32■■■■■ 5.17
TMED2-202ENST00000438031 GRIN2BQ13224 1484 aa47.28■■■■■ 5.16
TMED2-202ENST00000438031 ARAP1Q96P48 1450 aa47.27■■■■■ 5.16
TMED2-202ENST00000438031 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.27■■■■■ 5.16
TMED2-202ENST00000438031 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.13■■■■■ 5.14
TMED2-202ENST00000438031 SYNJ2O15056 1496 aa47.13■■■■■ 5.13
TMED2-202ENST00000438031 SYNJ1O43426 1573 aa47.12■■■■■ 5.13
TMED2-202ENST00000438031 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.12■■■■■ 5.13
TMED2-202ENST00000438031 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.04■■■■■ 5.12
TMED2-202ENST00000438031 TRHP20396 242 aaPredicted RBP47.02■■■■■ 5.12
TMED2-202ENST00000438031 PBRM1Q86U86 1689 aa47■■■■■ 5.12
TMED2-202ENST00000438031 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.92■■■■■ 5.1
TMED2-202ENST00000438031 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.89■■■■■ 5.1
TMED2-202ENST00000438031 TOP2BQ02880 1626 aa46.73■■■■■ 5.07
TMED2-202ENST00000438031 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.7■■■■■ 5.07
TMED2-202ENST00000438031 GRIN2AQ12879 1464 aa46.66■■■■■ 5.06
TMED2-202ENST00000438031 ADAMTS12P58397 1594 aa46.58■■■■■ 5.05
TMED2-202ENST00000438031 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.52■■■■■ 5.04
TMED2-202ENST00000438031 NUP160Q12769 1436 aa46.5■■■■■ 5.03
TMED2-202ENST00000438031 CEP170Q5SW79 1584 aa46.47■■■■■ 5.03
TMED2-202ENST00000438031 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.44■■■■■ 5.02
TMED2-202ENST00000438031 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.41■■■■■ 5.02
TMED2-202ENST00000438031 SHROOM2Q13796 1616 aa46.25■■■■■ 4.99
TMED2-202ENST00000438031 JPH4Q96JJ6 628 aa46.11■■■■■ 4.97
TMED2-202ENST00000438031 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP46.11■■■■■ 4.97
TMED2-202ENST00000438031 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa45.92■■■■■ 4.94
TMED2-202ENST00000438031 IGF1RP08069 1367 aa45.9■■■■■ 4.94
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