Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC7.35□□□□□ -1.232e-13■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-207ENST00000371239 2436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.254e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-205ENST00000371227 7279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.264e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 SORBS1-209ENST00000371245 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.274e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.47□□□□□ -1.374e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.54e-8■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.574e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.584e-8■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ARHGEF12-208ENST00000529970 3786 ntTSL 24.15□□□□□ -1.754e-7■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 ATRX-206ENST00000480283 10455 ntTSL 1 (best)3.67□□□□□ -1.824e-8■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-207ENST00000518285 507 ntTSL 318.85■□□□□ 0.611e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-221ENST00000522361 367 ntTSL 417.97■□□□□ 0.471e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-219ENST00000521223 587 ntTSL 417.55■□□□□ 0.41e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-209ENST00000518879 820 ntTSL 517.4■□□□□ 0.381e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-205ENST00000518167 421 ntTSL 516.78■□□□□ 0.281e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.121e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-210ENST00000519020 573 ntTSL 515.36■□□□□ 0.051e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.161e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-206ENST00000518283 574 ntTSL 47.55□□□□□ -1.21e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-227ENST00000523514 533 ntTSL 47.54□□□□□ -1.21e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-222ENST00000522702 544 ntTSL 46.73□□□□□ -1.331e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-228ENST00000523993 581 ntTSL 35.7□□□□□ -1.51e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.711e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 FAM49B-225ENST00000523288 4552 ntTSL 24.18□□□□□ -1.741e-9■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.661e-6■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.671e-6■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.681e-6■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.881e-6■■■■□ 25.7
AGGF1Q8N302 PISD-202ENST00000382151 2669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.277e-7■■■■□ 25.6
AGGF1Q8N302 MED13L-201ENST00000281928 14234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.12e-8■■■■□ 25.6
AGGF1Q8N302 MED13L-207ENST00000551197 489 ntTSL 55.73□□□□□ -1.492e-8■■■■□ 25.6
AGGF1Q8N302 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.425e-7■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.395e-7■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.225e-7■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 CRTC3-206ENST00000558619 593 ntTSL 416.25■□□□□ 0.195e-7■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 CRTC3-212ENST00000561218 579 ntTSL 315.54■□□□□ 0.085e-7■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 CRTC3-210ENST00000560927 2463 ntTSL 215.24■□□□□ 0.035e-7■■■■□ 25.5
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AGGF1Q8N302 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.453e-23■■■■□ 25.5
AGGF1Q8N302 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.956e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 NGEF-206ENST00000420650 519 ntTSL 513.65□□□□□ -0.226e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 CTDSPL2-201ENST00000260327 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.754e-10■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 CTDSPL2-207ENST00000559738 543 ntTSL 47.83□□□□□ -1.164e-10■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 CTDSPL2-206ENST00000559175 3609 ntTSL 25.96□□□□□ -1.464e-10■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.464e-10■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.144e-10■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.551e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 GYPC-205ENST00000464053 1805 ntTSL 1 (best)15.73■□□□□ 0.111e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.11e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 GYPC-204ENST00000459787 758 ntTSL 313.87□□□□□ -0.191e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.21e-7■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 SPN-205ENST00000563039 1853 ntTSL 519.68■□□□□ 0.743e-8■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.043e-8■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.062e-14■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.062e-14■■■■□ 25.4
AGGF1Q8N302 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-6■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 LGI4-204ENST00000493050 2200 ntTSL 1 (best)19.57■□□□□ 0.724e-7■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.524e-12■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 PTPDC1-204ENST00000620992 4437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.48□□□□□ -1.054e-12■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 PTPDC1-201ENST00000288976 4398 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.064e-12■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 PTPDC1-203ENST00000467049 1861 ntTSL 28.3□□□□□ -1.084e-12■■■■□ 25.3
AGGF1Q8N302 DAZAP1-204ENST00000586579 619 ntTSL 322.1■■□□□ 1.132e-8■■■■□ 25.2
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AGGF1Q8N302 KCNJ15-219ENST00000551422 413 ntTSL 29.87□□□□□ -0.831e-6■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 KCNJ15-213ENST00000547341 595 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 KCNJ15-216ENST00000549158 626 ntTSL 39.69□□□□□ -0.861e-6■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 KCNJ15-218ENST00000549932 555 ntTSL 29.5□□□□□ -0.891e-6■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 KCNJ15-215ENST00000548700 304 ntTSL 39.17□□□□□ -0.941e-6■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 DSCR8-205ENST00000472602 766 ntTSL 37.24□□□□□ -1.251e-6■■■■□ 25.2
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AGGF1Q8N302 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.382e-18■■■■□ 25.2
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AGGF1Q8N302 LCORL-205ENST00000510451 1013 ntTSL 212.84□□□□□ -0.352e-18■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 LCORL-207ENST00000635767 10430 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.682e-18■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 LCORL-208ENST00000637787 9431 ntTSL 54.57□□□□□ -1.682e-18■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -22e-18■■■■□ 25.2
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AGGF1Q8N302 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.065e-11■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.035e-11■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 INF2-201ENST00000252527 3050 ntTSL 214.75□□□□□ -0.055e-11■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 INF2-202ENST00000330634 7578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.345e-11■■■■□ 25.2
AGGF1Q8N302 HMGB1-206ENST00000405805 4199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.414e-7■■■■□ 25.1
AGGF1Q8N302 HMGB1-203ENST00000341423 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.094e-7■■■■□ 25.1
AGGF1Q8N302 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.452e-8■■■■□ 25.1
AGGF1Q8N302 DAZAP1-210ENST00000592453 1021 ntTSL 515.3■□□□□ 0.042e-8■■■■□ 25.1
AGGF1Q8N302 NUDCD3-203ENST00000460110 3641 ntTSL 1 (best)9.55□□□□□ -0.883e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 NUDCD3-205ENST00000472246 570 ntTSL 49.32□□□□□ -0.923e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -07e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-203ENST00000439616 2962 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.437e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-205ENST00000444676 3309 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.567e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-207ENST00000449767 3479 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-206ENST00000447398 3474 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.727e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-201ENST00000222673 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.747e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.957e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 OGDH-202ENST00000419661 789 ntTSL 58.29□□□□□ -1.087e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 AC105052.3-201ENST00000639209 1130 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.964e-6■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 LRRC75A-AS1-224ENST00000581718 574 ntTSL 218.99■□□□□ 0.638e-7■■■■□ 25
AGGF1Q8N302 DPEP1-205ENST00000564281 1772 ntTSL 518.44■□□□□ 0.544e-7■■■■□ 25
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