Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.046e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.176e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 SLC6A8-207ENST00000466243 544 ntTSL 214.16□□□□□ -0.144e-13■■■□□ 15
PUM1Q14671 CKB-217ENST00000557569 579 ntTSL 229.24■■■□□ 2.273e-9■■■□□ 15
PUM1Q14671 CKB-215ENST00000557287 565 ntTSL 216.63■□□□□ 0.253e-9■■■□□ 15
PUM1Q14671 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.263e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.491e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.291e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.261e-6■■■□□ 15
PUM1Q14671 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.352e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 MIR17HG-203ENST00000582141 2845 ntTSL 1 (best)16.62■□□□□ 0.252e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 MIR17HG-202ENST00000581816 2032 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-8■■■□□ 15
PUM1Q14671 SEPT5-207ENST00000431044 3173 ntTSL 1 (best)15.5■□□□□ 0.076e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 SEPT5-211ENST00000455843 4113 ntTSL 1 (best)13.62□□□□□ -0.236e-7■■■□□ 15
PUM1Q14671 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.393e-9■■■□□ 15
PUM1Q14671 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 28.81□□□□□ -13e-9■■■□□ 15
PUM1Q14671 SF3B2-209ENST00000530322 1163 ntTSL 517.15■□□□□ 0.343e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SF3B2-214ENST00000533595 1081 ntTSL 514.38□□□□□ -0.113e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 RALY-205ENST00000442805 871 ntTSL 528.39■■■□□ 2.143e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 RALY-202ENST00000333552 786 ntTSL 319.45■□□□□ 0.73e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 RALY-210ENST00000493399 513 ntTSL 514.31□□□□□ -0.123e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.931e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.551e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.322e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.71e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 KLF16-202ENST00000541015 1134 ntTSL 1 (best)23.87■■□□□ 1.411e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.541e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-204ENST00000445155 829 ntTSL 222.71■■□□□ 1.239e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.559e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.399e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.279e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-206ENST00000493946 874 ntTSL 211.67□□□□□ -0.549e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GSTO1-203ENST00000432659 592 ntTSL 24.94□□□□□ -1.629e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SURF6-202ENST00000468290 935 ntTSL 219.15■□□□□ 0.663e-9■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 MAP7D1-213ENST00000532131 771 ntTSL 526.14■■□□□ 1.783e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.13e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.013e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.444e-25■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 HIST1H2BD-201ENST00000289316 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.414e-25■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.72□□□□□ -1.176e-7■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GPATCH8-211ENST00000635257 5602 ntTSL 511.31□□□□□ -0.62e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GPATCH8-208ENST00000591680 4692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.82e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GPATCH8-205ENST00000587228 4713 ntTSL 1 (best)9.38□□□□□ -0.912e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GPATCH8-201ENST00000335500 8109 ntTSL 28.56□□□□□ -1.042e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SMAP2-205ENST00000539317 2501 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.752e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SMAP2-201ENST00000372708 2473 ntTSL 1 (best)9.32□□□□□ -0.922e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SMAP2-206ENST00000614549 2570 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 SLTM-216ENST00000558734 589 ntTSL 54.74□□□□□ -1.658e-14■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PPP2CA-201ENST00000231504 564 ntTSL 428.22■■■□□ 2.112e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 AC104109.4-201ENST00000520515 1744 ntTSL 27.37□□□□□ -1.232e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 NUCB2-206ENST00000527735 317 ntTSL 36.97□□□□□ -1.292e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PPP2CA-205ENST00000522385 585 ntTSL 36.95□□□□□ -1.32e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 AC104109.4-202ENST00000518409 1082 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.362e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PPP2CA-206ENST00000523082 510 ntTSL 43.82□□□□□ -1.82e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.161e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-202ENST00000327578 8287 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.231e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-212ENST00000519253 6443 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.131e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-221ENST00000524203 401 ntTSL 37.78□□□□□ -1.161e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-213ENST00000519802 796 ntTSL 26.88□□□□□ -1.311e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-208ENST00000518877 316 ntTSL 35.2□□□□□ -1.581e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-215ENST00000522275 2379 ntTSL 24.62□□□□□ -1.671e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.011e-11■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GABRE-208ENST00000483564 2747 ntTSL 38.72□□□□□ -1.015e-10■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GABRE-209ENST00000486255 6176 ntTSL 1 (best)8.65□□□□□ -1.035e-10■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 GABRE-212ENST00000495862 238 ntTSL 34.66□□□□□ -1.665e-10■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 WBP11-201ENST00000261167 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.612e-6■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.274e-8■■■□□ 14.9
PUM1Q14671 CDC37-210ENST00000593124 1389 ntTSL 520.01■□□□□ 0.792e-9■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CDC37-202ENST00000588498 690 ntTSL 318.53■□□□□ 0.562e-9■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CDC37-206ENST00000589629 728 ntTSL 314.57□□□□□ -0.082e-9■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 MAGOH-203ENST00000462941 738 ntTSL 211.12□□□□□ -0.631e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.024e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 VEGFA-215ENST00000497139 2746 ntTSL 1 (best)12.25□□□□□ -0.452e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 VEGFA-212ENST00000480614 12167 ntTSL 1 (best)9.34□□□□□ -0.912e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 GRIPAP1-211ENST00000619107 904 ntTSL 513.65□□□□□ -0.222e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NPM1-212ENST00000524204 640 ntTSL 27.49□□□□□ -1.211e-19■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 LDLR-201ENST00000252444 5337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.83□□□□□ -0.365e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 LDLR-214ENST00000560628 535 ntTSL 310.86□□□□□ -0.675e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 BCOR-208ENST00000413905 1945 ntTSL 511.98□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 BCOR-204ENST00000378463 2230 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.712e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NUCB1-203ENST00000411700 673 ntTSL 420.72■□□□□ 0.912e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CSNK2A2-204ENST00000565188 547 ntTSL 220.24■□□□□ 0.834e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NUCB1-206ENST00000451312 563 ntTSL 220.03■□□□□ 0.82e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-205ENST00000613930 988 ntTSL 219.07■□□□□ 0.642e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.524e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.511e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-206ENST00000615188 689 ntTSL 318.16■□□□□ 0.52e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-203ENST00000610642 1983 ntTSL 217.49■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-209ENST00000622176 1116 ntTSL 1 (best)17.17■□□□□ 0.342e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NUCB1-205ENST00000443560 551 ntTSL 416.61■□□□□ 0.252e-7■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.047e-9■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 NHP2-201ENST00000274606 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.367e-9■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-210ENST00000622186 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.472e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-204ENST00000613060 6526 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.492e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 SLC6A6-207ENST00000618278 6401 ntTSL 511.13□□□□□ -0.632e-6■■■□□ 14.8
PUM1Q14671 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.283e-7■■■□□ 14.8
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 102.4 ms