RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000314397.8

NHP2-202, Transcript of NHP2 ribonucleoprotein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene NHP2, Length 599 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2-202ENST00000314397 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.92■■■■□ 3.02
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NHP2-202ENST00000314397 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.16■■■□□ 2.26
NHP2-202ENST00000314397 DNAJC5BQ9UF47 199 aa29■■■□□ 2.23
NHP2-202ENST00000314397 NACADO15069 1562 aa28.92■■■□□ 2.22
NHP2-202ENST00000314397 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.7■■■□□ 2.18
NHP2-202ENST00000314397 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.56■■■□□ 2.16
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NHP2-202ENST00000314397 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.45■■■□□ 2.15
NHP2-202ENST00000314397 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.33■■■□□ 2.12
NHP2-202ENST00000314397 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.08■■■□□ 2.09
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NHP2-202ENST00000314397 SCRIBQ14160 1630 aa27.81■■■□□ 2.04
NHP2-202ENST00000314397 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.75■■■□□ 2.03
NHP2-202ENST00000314397 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.7■■■□□ 2.02
NHP2-202ENST00000314397 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.65■■■□□ 2.02
NHP2-202ENST00000314397 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.79■■□□□ 1.88
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NHP2-202ENST00000314397 CUX2O14529 1486 aa26.57■■□□□ 1.84
NHP2-202ENST00000314397 ERCC6Q03468 1493 aa26.54■■□□□ 1.84
NHP2-202ENST00000314397 SMARCA4P51532 1647 aa26.5■■□□□ 1.83
NHP2-202ENST00000314397 SMARCA2P51531 1590 aa26.5■■□□□ 1.83
NHP2-202ENST00000314397 HMGXB3Q12766 1538 aa26.48■■□□□ 1.83
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NHP2-202ENST00000314397 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
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NHP2-202ENST00000314397 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.13■■□□□ 1.77
NHP2-202ENST00000314397 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.13■■□□□ 1.77
NHP2-202ENST00000314397 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
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NHP2-202ENST00000314397 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.97■■□□□ 1.75
NHP2-202ENST00000314397 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.86■■□□□ 1.73
NHP2-202ENST00000314397 WIZO95785 1651 aa25.81■■□□□ 1.72
NHP2-202ENST00000314397 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.77■■□□□ 1.72
NHP2-202ENST00000314397 WDR62O43379 1518 aa25.72■■□□□ 1.71
NHP2-202ENST00000314397 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.63■■□□□ 1.69
NHP2-202ENST00000314397 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.58■■□□□ 1.69
NHP2-202ENST00000314397 CFTRP13569 1480 aa25.53■■□□□ 1.68
NHP2-202ENST00000314397 TRIM41Q8WV44 630 aa25.51■■□□□ 1.67
NHP2-202ENST00000314397 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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NHP2-202ENST00000314397 OSCARQ8IYS5 282 aa25.32■■□□□ 1.64
NHP2-202ENST00000314397 PRDM2Q13029 1718 aa25.28■■□□□ 1.64
NHP2-202ENST00000314397 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.18■■□□□ 1.62
NHP2-202ENST00000314397 IFT140Q96RY7 1462 aa25.12■■□□□ 1.61
NHP2-202ENST00000314397 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
NHP2-202ENST00000314397 TOPBP1Q92547 1522 aa25.07■■□□□ 1.6
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NHP2-202ENST00000314397 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.02■■□□□ 1.6
NHP2-202ENST00000314397 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.02■■□□□ 1.6
NHP2-202ENST00000314397 ABCC8Q09428 1581 aa25.01■■□□□ 1.59
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NHP2-202ENST00000314397 ARHGEF11O15085 1522 aa24.91■■□□□ 1.58
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NHP2-202ENST00000314397 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
NHP2-202ENST00000314397 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.73■■□□□ 1.55
NHP2-202ENST00000314397 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.71■■□□□ 1.55
NHP2-202ENST00000314397 FBLN2P98095 1184 aa24.71■■□□□ 1.55
NHP2-202ENST00000314397 SOGA1O94964 1423 aa24.69■■□□□ 1.54
NHP2-202ENST00000314397 ARAP1Q96P48 1450 aa24.66■■□□□ 1.54
NHP2-202ENST00000314397 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
NHP2-202ENST00000314397 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.62■■□□□ 1.53
NHP2-202ENST00000314397 WDR97A6NE52 1622 aa24.61■■□□□ 1.53
NHP2-202ENST00000314397 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.59■■□□□ 1.53
NHP2-202ENST00000314397 CUX1P39880 1505 aa24.56■■□□□ 1.52
NHP2-202ENST00000314397 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NHP2-202ENST00000314397 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.52■■□□□ 1.52
NHP2-202ENST00000314397 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NHP2-202ENST00000314397 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
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NHP2-202ENST00000314397 SYNJ2O15056 1496 aa24.44■■□□□ 1.5
NHP2-202ENST00000314397 PBRM1Q86U86 1689 aa24.4■■□□□ 1.5
NHP2-202ENST00000314397 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.38■■□□□ 1.49
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NHP2-202ENST00000314397 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.32■■□□□ 1.48
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NHP2-202ENST00000314397 GRIN2AQ12879 1464 aa24.18■■□□□ 1.46
NHP2-202ENST00000314397 ADAMTS12P58397 1594 aa24.15■■□□□ 1.46
NHP2-202ENST00000314397 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.13■■□□□ 1.45
NHP2-202ENST00000314397 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.12■■□□□ 1.45
NHP2-202ENST00000314397 TOP2BQ02880 1626 aa24.12■■□□□ 1.45
NHP2-202ENST00000314397 NUP160Q12769 1436 aa24.11■■□□□ 1.45
NHP2-202ENST00000314397 CEP170Q5SW79 1584 aa24.11■■□□□ 1.45
NHP2-202ENST00000314397 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.07■■□□□ 1.44
NHP2-202ENST00000314397 SHROOM2Q13796 1616 aa24.03■■□□□ 1.44
NHP2-202ENST00000314397 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.02■■□□□ 1.44
NHP2-202ENST00000314397 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
NHP2-202ENST00000314397 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
NHP2-202ENST00000314397 JPH4Q96JJ6 628 aa23.86■■□□□ 1.41
NHP2-202ENST00000314397 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.82■■□□□ 1.4
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