RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557569.1

CKB-217, Transcript of creatine kinase B, humanhuman

TSL 2

Gene CKB, Length 579 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKB-217ENST00000557569 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.89■■■■■ 8.3
CKB-217ENST00000557569 ABCC9O60706 1549 aa60.83■■■■■ 7.33
CKB-217ENST00000557569 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa60.15■■■■■ 7.22
CKB-217ENST00000557569 DNAJC5BQ9UF47 199 aa57.69■■■■■ 6.83
CKB-217ENST00000557569 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa57.55■■■■■ 6.8
CKB-217ENST00000557569 NACADO15069 1562 aa57.04■■■■■ 6.72
CKB-217ENST00000557569 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.69■■■■■ 6.67
CKB-217ENST00000557569 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP56.6■■■■■ 6.65
CKB-217ENST00000557569 UNC13AQ9UPW8 1703 aa56.23■■■■■ 6.59
CKB-217ENST00000557569 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.09■■■■■ 6.57
CKB-217ENST00000557569 BICRAQ9NZM4 1560 aa56.02■■■■■ 6.56
CKB-217ENST00000557569 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.33■■■■■ 6.45
CKB-217ENST00000557569 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa55.18■■■■■ 6.42
CKB-217ENST00000557569 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa55.09■■■■■ 6.41
CKB-217ENST00000557569 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa54.88■■■■■ 6.38
CKB-217ENST00000557569 SCRIBQ14160 1630 aa54.86■■■■■ 6.37
CKB-217ENST00000557569 CECR2Q9BXF3 1484 aa54.84■■■■■ 6.37
CKB-217ENST00000557569 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP54.63■■■■■ 6.34
CKB-217ENST00000557569 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa53.27■■■■■ 6.12
CKB-217ENST00000557569 NCAPD3P42695 1498 aa52.74■■■■■ 6.03
CKB-217ENST00000557569 CUX2O14529 1486 aa52.58■■■■■ 6.01
CKB-217ENST00000557569 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.52■■■■■ 6
CKB-217ENST00000557569 ERCC6Q03468 1493 aa52.48■■■■■ 5.99
CKB-217ENST00000557569 SMARCA4P51532 1647 aa52.26■■■■■ 5.96
CKB-217ENST00000557569 SMARCA2P51531 1590 aa52.25■■■■■ 5.95
CKB-217ENST00000557569 HMGXB3Q12766 1538 aa52.24■■■■■ 5.95
CKB-217ENST00000557569 NESP48681 1621 aa52.14■■■■■ 5.94
CKB-217ENST00000557569 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.92■■■■■ 5.9
CKB-217ENST00000557569 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.91■■■■■ 5.9
CKB-217ENST00000557569 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.77■■■■■ 5.88
CKB-217ENST00000557569 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP51.65■■■■■ 5.86
CKB-217ENST00000557569 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.58■■■■■ 5.85
CKB-217ENST00000557569 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa51.55■■■■■ 5.84
CKB-217ENST00000557569 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa51.32■■■■■ 5.81
CKB-217ENST00000557569 PDS5BQ9NTI5 1447 aa51.3■■■■■ 5.8
CKB-217ENST00000557569 CADPSQ9ULU8 1353 aa51.11■■■■■ 5.77
CKB-217ENST00000557569 MRC2Q9UBG0 1479 aa50.92■■■■■ 5.74
CKB-217ENST00000557569 WIZO95785 1651 aa50.88■■■■■ 5.74
CKB-217ENST00000557569 WDR62O43379 1518 aa50.82■■■■■ 5.73
CKB-217ENST00000557569 TRIM41Q8WV44 630 aa50.69■■■■■ 5.71
CKB-217ENST00000557569 CEP164Q9UPV0 1460 aa50.59■■■■■ 5.69
CKB-217ENST00000557569 FANCD2Q9BXW9 1451 aa50.52■■■■■ 5.68
CKB-217ENST00000557569 CFTRP13569 1480 aa50.42■■■■■ 5.66
CKB-217ENST00000557569 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
CKB-217ENST00000557569 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.62
CKB-217ENST00000557569 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP50.19■■■■■ 5.62
CKB-217ENST00000557569 OSCARQ8IYS5 282 aa50.12■■■■■ 5.61
CKB-217ENST00000557569 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.69■■■■■ 5.54
CKB-217ENST00000557569 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP49.68■■■■■ 5.54
CKB-217ENST00000557569 PRDM2Q13029 1718 aa49.67■■■■■ 5.54
CKB-217ENST00000557569 IFT140Q96RY7 1462 aa49.61■■■■■ 5.53
CKB-217ENST00000557569 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa49.52■■■■■ 5.52
CKB-217ENST00000557569 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa49.52■■■■■ 5.52
CKB-217ENST00000557569 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa49.52■■■■■ 5.52
CKB-217ENST00000557569 TOPBP1Q92547 1522 aa49.51■■■■■ 5.52
CKB-217ENST00000557569 ARHGEF11O15085 1522 aa49.34■■■■■ 5.49
CKB-217ENST00000557569 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
CKB-217ENST00000557569 ABCC8Q09428 1581 aa49.27■■■■■ 5.48
CKB-217ENST00000557569 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.24■■■■■ 5.47
CKB-217ENST00000557569 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP49.14■■■■■ 5.461e-7■■■■□ 23.9
CKB-217ENST00000557569 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP49.1■■■■■ 5.45
CKB-217ENST00000557569 CYB5RLQ6IPT4 315 aa49.02■■■■■ 5.44
CKB-217ENST00000557569 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.98■■■■■ 5.43
CKB-217ENST00000557569 CHD1O14646 1710 aa48.97■■■■■ 5.43
CKB-217ENST00000557569 FBLN2P98095 1184 aa48.87■■■■■ 5.41
CKB-217ENST00000557569 ARAP1Q96P48 1450 aa48.86■■■■■ 5.41
CKB-217ENST00000557569 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.85■■■■■ 5.41
CKB-217ENST00000557569 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.77■■■■■ 5.4
CKB-217ENST00000557569 SOGA1O94964 1423 aa48.74■■■■■ 5.39
CKB-217ENST00000557569 TRHP20396 242 aaPredicted RBP48.6■■■■■ 5.37
CKB-217ENST00000557569 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa48.6■■■■■ 5.37
CKB-217ENST00000557569 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.59■■■■■ 5.37
CKB-217ENST00000557569 CUX1P39880 1505 aa48.49■■■■■ 5.35
CKB-217ENST00000557569 CLASP1Q7Z460 1538 aa48.48■■■■■ 5.35
CKB-217ENST00000557569 WDR97A6NE52 1622 aa48.46■■■■■ 5.35
CKB-217ENST00000557569 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP48.41■■■■■ 5.34
CKB-217ENST00000557569 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
CKB-217ENST00000557569 GRIN2BQ13224 1484 aa48.35■■■■■ 5.33
CKB-217ENST00000557569 SYNJ1O43426 1573 aa48.31■■■■■ 5.32
CKB-217ENST00000557569 SYNJ2O15056 1496 aa48.26■■■■■ 5.32
CKB-217ENST00000557569 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.11■■■■■ 5.29
CKB-217ENST00000557569 PBRM1Q86U86 1689 aa48.04■■■■■ 5.28
CKB-217ENST00000557569 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.99■■■■■ 5.27
CKB-217ENST00000557569 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.96■■■■■ 5.27
CKB-217ENST00000557569 ERCC6L2Q5T890 1561 aa47.75■■■■■ 5.24
CKB-217ENST00000557569 GRIN2AQ12879 1464 aa47.74■■■■■ 5.23
CKB-217ENST00000557569 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.67■■■■■ 5.22
CKB-217ENST00000557569 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.66■■■■■ 5.22
CKB-217ENST00000557569 ADAMTS12P58397 1594 aa47.64■■■■■ 5.22
CKB-217ENST00000557569 NUP160Q12769 1436 aa47.64■■■■■ 5.22
CKB-217ENST00000557569 CEP170Q5SW79 1584 aa47.62■■■■■ 5.21
CKB-217ENST00000557569 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP47.53■■■■■ 5.2
CKB-217ENST00000557569 TOP2BQ02880 1626 aa47.48■■■■■ 5.19
CKB-217ENST00000557569 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.48■■■■■ 5.19
CKB-217ENST00000557569 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.47■■■■■ 5.19
CKB-217ENST00000557569 SHROOM2Q13796 1616 aa47.44■■■■■ 5.18
CKB-217ENST00000557569 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.34■■■■■ 5.17
CKB-217ENST00000557569 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP47.21■■■■■ 5.15
CKB-217ENST00000557569 JPH4Q96JJ6 628 aa47.14■■■■■ 5.14
CKB-217ENST00000557569 KIF13AQ9H1H9 1805 aa47.05■■■■■ 5.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.7 ms