RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000231504.5

PPP2CA-201, Transcript of protein phosphatase 2 catalytic subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene PPP2CA, Length 564 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2CA-201ENST00000231504 NISCHQ9Y2I1 1504 aa66.48■■■■■ 8.23
PPP2CA-201ENST00000231504 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.54■■■■■ 7.12
PPP2CA-201ENST00000231504 ABCC9O60706 1549 aa58.89■■■■■ 7.02
PPP2CA-201ENST00000231504 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa56.34■■■■■ 6.61
PPP2CA-201ENST00000231504 NACADO15069 1562 aa56.09■■■■■ 6.57
PPP2CA-201ENST00000231504 DCAF8L2P0C7V8 631 aa55.74■■■■■ 6.51
PPP2CA-201ENST00000231504 MYO15BQ96JP2 1530 aa55.49■■■■■ 6.47
PPP2CA-201ENST00000231504 UNC13AQ9UPW8 1703 aa55.24■■■■■ 6.43
PPP2CA-201ENST00000231504 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP55.23■■■■■ 6.43
PPP2CA-201ENST00000231504 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa54.97■■■■■ 6.39
PPP2CA-201ENST00000231504 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.85■■■■■ 6.37
PPP2CA-201ENST00000231504 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.73■■■■■ 6.35
PPP2CA-201ENST00000231504 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.71■■■■■ 6.35
PPP2CA-201ENST00000231504 SCRIBQ14160 1630 aa54.22■■■■■ 6.27
PPP2CA-201ENST00000231504 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.01■■■■■ 6.24
PPP2CA-201ENST00000231504 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP53.31■■■■■ 6.12
PPP2CA-201ENST00000231504 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa53.3■■■■■ 6.12
PPP2CA-201ENST00000231504 CECR2Q9BXF3 1484 aa53■■■■■ 6.07
PPP2CA-201ENST00000231504 SMARCA4P51532 1647 aa51.8■■■■■ 5.88
PPP2CA-201ENST00000231504 NCAPD3P42695 1498 aa51.73■■■■■ 5.87
PPP2CA-201ENST00000231504 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa51.65■■■■■ 5.86
PPP2CA-201ENST00000231504 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP51.58■■■■■ 5.85
PPP2CA-201ENST00000231504 SMARCA2P51531 1590 aa51.57■■■■■ 5.85
PPP2CA-201ENST00000231504 HMGXB3Q12766 1538 aa51.45■■■■■ 5.83
PPP2CA-201ENST00000231504 PEG3Q9GZU2 1588 aa51.3■■■■■ 5.8
PPP2CA-201ENST00000231504 MROH2BQ7Z745 1585 aa51.23■■■■■ 5.79
PPP2CA-201ENST00000231504 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.18■■■■■ 5.78
PPP2CA-201ENST00000231504 ERCC6Q03468 1493 aa50.8■■■■■ 5.72
PPP2CA-201ENST00000231504 NESP48681 1621 aa50.76■■■■■ 5.72
PPP2CA-201ENST00000231504 WIZO95785 1651 aa50.7■■■■■ 5.71
PPP2CA-201ENST00000231504 CUX2O14529 1486 aa50.57■■■■■ 5.69
PPP2CA-201ENST00000231504 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.54■■■■■ 5.68
PPP2CA-201ENST00000231504 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP50.33■■■■■ 5.65
PPP2CA-201ENST00000231504 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa50.24■■■■■ 5.63
PPP2CA-201ENST00000231504 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP50.22■■■■■ 5.63
PPP2CA-201ENST00000231504 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.15■■■■■ 5.62
PPP2CA-201ENST00000231504 PDS5BQ9NTI5 1447 aa50.14■■■■■ 5.62
PPP2CA-201ENST00000231504 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP50.06■■■■■ 5.6
PPP2CA-201ENST00000231504 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.87■■■■■ 5.57
PPP2CA-201ENST00000231504 CFTRP13569 1480 aa49.73■■■■■ 5.55
PPP2CA-201ENST00000231504 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.72■■■■■ 5.55
PPP2CA-201ENST00000231504 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.63■■■■■ 5.53
PPP2CA-201ENST00000231504 WDR62O43379 1518 aa49.62■■■■■ 5.53
PPP2CA-201ENST00000231504 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.61■■■■■ 5.53
PPP2CA-201ENST00000231504 PRDM2Q13029 1718 aa49.48■■■■■ 5.51
PPP2CA-201ENST00000231504 CCDC88BA6NC98 1476 aa49.44■■■■■ 5.51
PPP2CA-201ENST00000231504 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.19■■■■■ 5.47
PPP2CA-201ENST00000231504 TOPBP1Q92547 1522 aa48.75■■■■■ 5.39
PPP2CA-201ENST00000231504 ABCC8Q09428 1581 aa48.67■■■■■ 5.38
PPP2CA-201ENST00000231504 DNMBPQ6XZF7 1577 aa48.65■■■■■ 5.38
PPP2CA-201ENST00000231504 IFT140Q96RY7 1462 aa48.61■■■■■ 5.37
PPP2CA-201ENST00000231504 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.48■■■■■ 5.35
PPP2CA-201ENST00000231504 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP48.4■■■■■ 5.34
PPP2CA-201ENST00000231504 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.33■■■■■ 5.33
PPP2CA-201ENST00000231504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.31■■■■■ 5.32
PPP2CA-201ENST00000231504 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.28■■■■■ 5.32
PPP2CA-201ENST00000231504 OSCARQ8IYS5 282 aa48.26■■■■■ 5.32
PPP2CA-201ENST00000231504 CUX1P39880 1505 aa48.12■■■■■ 5.29
PPP2CA-201ENST00000231504 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.08■■■■■ 5.295e-8■■■■■ 37.7
PPP2CA-201ENST00000231504 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.07■■■■■ 5.29
PPP2CA-201ENST00000231504 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.06■■■■■ 5.28
PPP2CA-201ENST00000231504 SOGA1O94964 1423 aa48.02■■■■■ 5.28
PPP2CA-201ENST00000231504 CHD1O14646 1710 aa47.92■■■■■ 5.26
PPP2CA-201ENST00000231504 WDR97A6NE52 1622 aa47.89■■■■■ 5.26
PPP2CA-201ENST00000231504 TRIM41Q8WV44 630 aa47.87■■■■■ 5.25
PPP2CA-201ENST00000231504 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP47.85■■■■■ 5.25
PPP2CA-201ENST00000231504 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
PPP2CA-201ENST00000231504 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
PPP2CA-201ENST00000231504 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa47.71■■■■■ 5.23
PPP2CA-201ENST00000231504 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.64■■■■■ 5.22
PPP2CA-201ENST00000231504 FBLN2P98095 1184 aa47.59■■■■■ 5.21
PPP2CA-201ENST00000231504 ARHGEF11O15085 1522 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP2CA-201ENST00000231504 GRIN2BQ13224 1484 aa47.58■■■■■ 5.21
PPP2CA-201ENST00000231504 PBRM1Q86U86 1689 aa47.57■■■■■ 5.21
PPP2CA-201ENST00000231504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
PPP2CA-201ENST00000231504 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa47.55■■■■■ 5.2
PPP2CA-201ENST00000231504 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa47.55■■■■■ 5.2
PPP2CA-201ENST00000231504 TOP2BQ02880 1626 aa47.52■■■■■ 5.2
PPP2CA-201ENST00000231504 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa47.49■■■■■ 5.19
PPP2CA-201ENST00000231504 GAPVD1Q14C86 1478 aa47.48■■■■■ 5.19
PPP2CA-201ENST00000231504 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP47.47■■■■■ 5.19
PPP2CA-201ENST00000231504 SYNJ1O43426 1573 aa47.47■■■■■ 5.19
PPP2CA-201ENST00000231504 SYNJ2O15056 1496 aa47.37■■■■■ 5.17
PPP2CA-201ENST00000231504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.34■■■■■ 5.17
PPP2CA-201ENST00000231504 CLASP1Q7Z460 1538 aa47.3■■■■■ 5.16
PPP2CA-201ENST00000231504 ARAP1Q96P48 1450 aa47.14■■■■■ 5.14
PPP2CA-201ENST00000231504 CYB5RLQ6IPT4 315 aa47.09■■■■■ 5.13
PPP2CA-201ENST00000231504 ADAMTS12P58397 1594 aa47.08■■■■■ 5.13
PPP2CA-201ENST00000231504 GRIN2AQ12879 1464 aa46.99■■■■■ 5.11
PPP2CA-201ENST00000231504 ERICH3Q5RHP9 1530 aa46.97■■■■■ 5.11
PPP2CA-201ENST00000231504 FHAD1B1AJZ9 1412 aa46.89■■■■■ 5.1
PPP2CA-201ENST00000231504 CEP170Q5SW79 1584 aa46.83■■■■■ 5.09
PPP2CA-201ENST00000231504 NUP160Q12769 1436 aa46.81■■■■■ 5.08
PPP2CA-201ENST00000231504 SHROOM2Q13796 1616 aa46.61■■■■■ 5.05
PPP2CA-201ENST00000231504 ERCC6L2Q5T890 1561 aa46.6■■■■■ 5.05
PPP2CA-201ENST00000231504 KIF27Q86VH2 1401 aa46.53■■■■■ 5.04
PPP2CA-201ENST00000231504 CUL7Q14999 1698 aa46.44■■■■■ 5.02
PPP2CA-201ENST00000231504 IGF1RP08069 1367 aa46.42■■■■■ 5.02
PPP2CA-201ENST00000231504 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa46.41■■■■■ 5.02
PPP2CA-201ENST00000231504 TRHP20396 242 aaPredicted RBP46.38■■■■■ 5.02
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