Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 MS4A3-204ENST00000525686 746 ntTSL 314.06□□□□□ -0.163e-7■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.143e-6■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 ACSF3-207ENST00000537155 848 ntTSL 216.04■□□□□ 0.163e-6■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 ACSF3-206ENST00000537116 2496 ntTSL 213.33□□□□□ -0.283e-6■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 ACSF3-203ENST00000393145 7020 nt12.95□□□□□ -0.343e-6■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 EIF3H-203ENST00000518034 1047 ntTSL 212.85□□□□□ -0.351e-7■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 EIF3H-204ENST00000518949 843 ntTSL 311.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 EIF3H-205ENST00000518995 731 ntTSL 311.7□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 EIF3H-211ENST00000522800 635 ntTSL 310.09□□□□□ -0.791e-7■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 EIF3H-210ENST00000522453 518 ntTSL 39.71□□□□□ -0.861e-7■■■■■ 31.8
PABPC4Q13310 EIF3H-202ENST00000517974 594 ntTSL 27.04□□□□□ -1.281e-7■■■■■ 31.8
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PABPC4Q13310 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.859e-7■■■■■ 31.7
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PABPC4Q13310 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.013e-12■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-12■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.263e-12■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 KAT5-213ENST00000533596 709 ntTSL 314.63□□□□□ -0.073e-12■■■■■ 31.7
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PABPC4Q13310 CTDSPL-207ENST00000447745 793 ntTSL 312.11□□□□□ -0.474e-13■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 CTDSPL-205ENST00000436654 804 ntTSL 310.84□□□□□ -0.674e-13■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.874e-13■■■■■ 31.7
PABPC4Q13310 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.173e-14■■■■■ 31.7
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PABPC4Q13310 NPEPPS-201ENST00000322157 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.533e-8■■■■■ 31.6
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PABPC4Q13310 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-8■■■■■ 31.6
PABPC4Q13310 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.514e-9■■■■■ 31.6
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PABPC4Q13310 STXBP2-213ENST00000599278 295 ntTSL 318.01■□□□□ 0.473e-21■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.083e-8■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 YWHAH-205ENST00000471374 1735 ntTSL 221.85■■□□□ 1.098e-9■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 31.4
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PABPC4Q13310 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.033e-37■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 AC008575.2-201ENST00000503445 506 ntTSL 314.3□□□□□ -0.123e-37■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 AC008575.2-202ENST00000506997 1643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.383e-37■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 SRP19-204ENST00000505459 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.723e-37■■■■■ 31.4
PABPC4Q13310 AC008575.2-204ENST00000509024 474 ntTSL 25.98□□□□□ -1.453e-37■■■■■ 31.4
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PABPC4Q13310 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.815e-11■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 MAEA-215ENST00000512289 2426 ntTSL 218.7■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.585e-11■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 MAEA-204ENST00000503162 2069 ntTSL 216.98■□□□□ 0.315e-11■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 MAEA-220ENST00000515766 3136 ntTSL 216.77■□□□□ 0.275e-11■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 CNOT10-205ENST00000435630 2290 ntTSL 1 (best)13.73□□□□□ -0.213e-12■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.896e-8■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GMDS-AS1-209ENST00000532124 629 ntTSL 423.78■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GMDS-AS1-203ENST00000524770 565 ntTSL 323.78■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GMDS-AS1-206ENST00000530346 594 ntTSL 421.78■■□□□ 1.083e-7■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.981e-13■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.863e-7■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 RMND5B-204ENST00000507575 2092 ntTSL 220.22■□□□□ 0.831e-13■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-13■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.412e-12■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 GMDS-AS1-208ENST00000531092 744 ntTSL 316.46■□□□□ 0.233e-7■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.192e-12■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.132e-12■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.131e-13■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 AL136295.3-201ENST00000558325 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.11e-13■■■■■ 31.3
PABPC4Q13310 RMND5B-212ENST00000542098 1681 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.031e-13■■■■■ 31.3
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